背景及概述[1]
核酸酶是一類催化核苷酸和核酸中的磷酸二酯鍵水解的酶,分內(nèi)切核酸酶(endonucleases)和外切核酸酶(ex-onucleases),對紫外線引起的DNA大型光損傷和各種化學(xué)物與DNA形成的加合物的切除修復(fù)中起作用。在N-糖基化酶切除異常的堿基形成AP位點(diǎn)(見切除修復(fù))后,如插入酶將正確的堿基插入AP位點(diǎn)仍不能達(dá)到完全修復(fù)時(shí),即由AP內(nèi)切核酸酶在AP位點(diǎn)或其旁邊的5′端將DNA切開一個(gè)缺口,使一端成為5′-磷酸基,另一端成為3′-OH基。隨之外切核酸酶再切除一些堿基。除AP內(nèi)切核酸酶外,還有一些對某些DNA損傷有特異性的內(nèi)切核酸酶。其中較特殊的是切除由紫外線產(chǎn)生的嘧啶二聚體的UV內(nèi)切核酸酶。它有時(shí)還能作用于許多較大的螺旋扭曲變形損傷。由于UV內(nèi)切核酸酶還具有外切作用,有時(shí)稱之為“切除核酸酶”(ex-cinuclease)。參見切除修復(fù)、聚合和連接酶。
熱敏型雙鏈DNA特異性核酸酶是雙鏈DNA特異性核酸酶。其特異性的識別降解雙鏈DNA,對單鏈DNA或RNA幾乎無活性,其降解dsDNA的能力比ssDNA高~5000倍。除此外,該雙鏈DNA特異性核酸酶降解雙鏈DNA的能力比bovineDNaseI高~30倍,因此特別適用于去除RNA樣品中的基因組DNA污染。熱敏型雙鏈DNA特異性核酸酶可將DNA降解為2~8bp的產(chǎn)物,且55℃5分鐘可使該酶不可逆失活,同時(shí)又能保持RNA和ssDNA的穩(wěn)定性,因此產(chǎn)物無需再純化,可直接用于后續(xù)反應(yīng)。同時(shí)該酶與M-MLV和AMV的反應(yīng)Buffer都是兼容的,可應(yīng)用于反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中去除樣本中基因組DNA的污染,提高反轉(zhuǎn)錄效率。
使用注意事項(xiàng)[1]
1.1×dsDNaseBuffer:20mMTris-HClpH8,2mMMgCl2。該酶需要1~3mMMgCl2。
2.該酶對DTT敏感,任何反應(yīng)體系中不得包含DTT。
3.通常在RT反應(yīng)中的用量為0.1~0.5U/20μl體系。
4.任何濃度的SDS、鹽酸胍、β-mercaptoethanol或高鹽離子(>300mM)均抑制該酶活性。
5.該酶的反應(yīng)溫度為25~37℃,42℃30分鐘后活性損失70%。
主要參考資料
[1] 衛(wèi)生學(xué)大辭典