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甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(Fpg)的應(yīng)用

2020/1/20 8:50:27

背景及概述[1]

Escherichiacoli中存在著一類特異識別 8-羥基鳥嘌呤的修復(fù)酶:甲酰胺嘧啶 -DNA糖基化酶,這類酶可以將 8-羥基鳥嘌呤從DNA中清除,以保證細胞遺傳信息的穩(wěn)定性,人與Sacharomycescerevisiae同樣存在這類修復(fù)酶。Fpg (formamidopyrimidine [fapy]-DNA glycosylase,甲酰胺嘧啶 [fapy]-DNA 糖基化酶)也稱作 8-氧代鳥嘌呤 DNA 糖基化酶、甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(Fpg),既有 N-端糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-端糖基化酶活性可以切下雙鏈 DNA 上受損的嘌呤堿基,產(chǎn)生一個脫嘌呤(AP)位點。AP-裂解酶活性可以切割 AP 位點的 3´ 或 5´ 端,因此可以除去 AP 位點,產(chǎn)生一個具有 3´ 和 5´ 磷酸的堿基缺口。被 Fpg 識別并切除的受損堿基包括:7,8-二羥基-8-氧代鳥嘌呤(8-氧代鳥嘌呤)、8-羥基腺嘌呤、fapy-鳥嘌呤、甲基-fapy-鳥嘌呤、fapy-腺嘌呤、黃曲霉毒素 B1-fapy-鳥嘌呤、5-羥基-胞嘧啶和 5-羥基尿嘧啶。

特性

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(Fpg)具體有下列特點:

1. 單細胞凝膠電泳 (彗星試驗),彗星試驗的推薦稀釋倍數(shù),1:103~1:104

2. 堿性析出

3. 堿解旋

4. 修飾的切刻平移技術(shù)

組分

名稱

數(shù)量

Fpg (8 U/μl)

100 μl/500 μl

10X Fpg Reaction Buffer

1 ml/1 ml×2

應(yīng)用

單細胞凝膠電泳;

DNA損傷和修復(fù)研究;

SNP分析。

單位定義

1 單位指在 10 μl 反應(yīng)體系中,37℃條件下, 1 小時內(nèi)能夠切割 1 pmol 含單個與胞嘧啶配對的 8-氧代鳥嘌呤的 34 bp 寡核苷酸雙鏈所需要的酶量定義為一個活性單位。

反應(yīng)條件

10 mM Bis-Tris(pH 7.0),10 mM MgCl2 ,1mM DTT, 100 μg/ml BSA,37℃ 溫育

酶儲存液

50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 50 mM KCl, 1 mM DTT, 50% Glycerol.

熱失活       

60°C 10min。

儲存

置于-20°C可保存2年,避免反復(fù)凍融。

主要參考文獻

[1] 張海濤, 祝其鋒. 細胞中特異識別 8—羥基鳥嘌呤的修復(fù)酶[D]. , 2001.

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