真菌基因組DNA提取試劑盒(目錄號:RTG2407)
● 試劑盒內(nèi)容及保存:
● 儲存條件和效期:
室溫保存,24個月內(nèi)有效。Buffer C2于Buffer C3可能有沉淀產(chǎn)生,37℃水浴溶解后即可。RNase A常溫運輸,-20℃保存。
● 產(chǎn)品簡介:
該試劑盒采用簡便的硅膠柱結(jié)合純化方式和獨特的溶液處理系統(tǒng),可在60分鐘內(nèi)可處理多個100mg新鮮或30mg干燥真菌組織樣品。獨特的緩沖液與硅膠柱可以有效的去除組織裂解物種的多糖,酚類,以及酶抑制物。該試劑盒提取到的DNA可以用于PCR,Southern雜交,酶切消化等實驗。無需使用酚氯仿等有機,可以同時進行多個樣品的處理。
● 準備工作:
1. 準備65℃水浴;無水乙醇;異丙醇;制冰機;1.5ml離心管;2ml離心管
2. 按照標簽所示在漂洗緩沖液PW中加入無水乙醇,混勻后蓋緊瓶蓋后室溫貯存?zhèn)溆谩?/p>
3. 每次使用前請檢查緩沖液R2,緩沖液R3是否有沉淀生成,如果出現(xiàn)沉淀,37℃溫浴至沉淀溶解后再使用。
● 標準操作步驟:
如非指出,所有離心步驟均為使用臺式離心機在室溫下離心。
1.樣品的處理:
A.新鮮樣品:新鮮樣品可以用液氮研磨成粉末?;蛘咴?5℃烘箱下過夜來干燥后按干燥樣品進行操作。
B.干燥樣品:用研缽或研磨研杵研磨成粉末。
2. 小于100mg新鮮樣品或者小于20mg干燥樣品,加入600μl Buffer C1及4μl RNase A渦旋混勻。
3.65℃水浴10分鐘。孵育過程中短暫渦旋管子幾次。
4. 加入150μl Buffer C2,顛倒振蕩混勻,冰上放置1分鐘后10,000×g下離心3min。 (離心后應(yīng)分層,如還有漂浮物,請延長離心時間)。
5. 小心地把上清液吸至另一新的小離心管中。注意確保不要打散沉淀團或把組織碎片也一起轉(zhuǎn)移。
6. 加入二分之一上清體積的 Buffer C3與與等體積的無水乙醇,充分混勻。如:向300μl 上清中加入150μl Buffer C3與300μl無水乙醇。
7. 把上述混勻的液體轉(zhuǎn)移到分離柱上。10,000×g離心1 min以結(jié)合DNA,棄去濾出液體。純化柱容量為750μl,如果混合液大于750μl,請分兩次過柱。
8. 將GBC吸附柱重新套回收集管中,加入600μl DNA Wash Buffer(使用前須按要求用無水乙醇稀釋)至柱子中,10,000×g離心1min,倒棄流出液;
9.再加入600μl DNA Wash Buffer至柱子中,8,000×g離心1min,棄去流出液;
10. 將吸附柱重新套回2ml收集管中,轉(zhuǎn)速(>13.000xg)離心空結(jié)合柱1min以干燥柱子的基質(zhì);這一步對下面的洗脫步驟至關(guān)重要。
12. 將柱子置于1.5ml滅菌離心管,加入50-150μl65℃預(yù)熱的T洗脫緩沖液EB至柱子的膜中央。室溫靜置5min;
13. 室溫下,離心(>13000g)1min,以洗脫DNA。保留含DNA的流出液。將DNA儲于-20℃。
對低DNA含量的樣品按如下操作:
1. 收集研磨成粉末的植物組織,新鮮組織約400mg(干燥組織約200mg),置樣品于15ml離心管中。
2. 加入9ml Buffer C1,劇烈地漩渦振蕩。
3.65℃水浴30-60min。水浴期間顛倒樣品數(shù)次。
4. 加入2.5ml Buffer C2,充分混勻,3000×g離心10分鐘。轉(zhuǎn)移上清到新的15ml離心管中,加入0.7倍的異丙醇,3000×g離心10分鐘。
5. 倒掉上清,加入300μl的滅菌去離子水與5μl RNaseA。65℃水浴溶解DNA。
6. DNA完全溶解后,加入150μl Buffer C3與300μl無水乙醇。
7. 按標準操作步驟的第七步,繼續(xù)往下操作。
● DNA濃度及純度檢測:
基因組DNA片段的大小與樣品保存時間、操作過程中的剪切力等因素有關(guān)。提取的DNA片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度??膳渲?.8-1.0%瓊脂糖凝膠,使用λ/HindIII判斷基因組的大小,完整的基因組大小應(yīng)在23kb以上。使用分光光度計檢測時, OD260/OD280比值應(yīng)為1.7–1.9之間,如果洗脫時不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水洗脫,比值可能偏低,但并不表明DNA純度不高。
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