產(chǎn)品簡介
真菌是具有真核和細胞壁的異養(yǎng)生物,種屬很多,已報道的屬達 1 萬以上,種超過 10 萬個。真菌通常又分為三類,即酵母菌、霉菌和蕈菌(大型真菌)。對于酵母菌和霉菌,可以用玻璃珠處理,而對于大型真菌,可直接用液氮研磨。經(jīng)過前期處理的菌液,用硅質(zhì)膜吸附,即可得到高純度的基因組。提取純化后的 DNA,可以直接用于PCR/Real time-PCR,sequencing,Southern blot,mutant analysis,SNP 等下游應用實驗。
產(chǎn)品組分
操作步驟:
使用前請先在漂洗液中加入無水乙醇,加入體積請參照瓶體上的標簽。所有離心步驟均為使用臺式離心機在室溫下離心。
1、樣品的處理:
1)對于酵母菌,取 1-2ml 培養(yǎng)好的菌液,離心收集,棄上清。加入 200ul 溶液 A,加入 20ul RNase A,再加入 100mg 玻璃珠,在高速振蕩器上振蕩,約 5-10min。
2)霉菌(孢子也可相同處理):取 50-100mg 菌絲,加 200ul 溶液 A,用玻璃研磨器適當研磨分散菌絲,加入20ul RNase A,再加入 100mg 玻璃珠,在高速振蕩器上振蕩,約 30min。
3)大型真菌(如蘑菇等):稱取 50-100mg 樣品,倒入適量的液氮,立即研磨重復 3 次,使樣品研成粉末(如無液氮,可加 200ul 溶液 A 后用玻璃研磨器適當研磨),加 200ul 溶液 A,加入 20ul RNase A,再加入 100mg 玻璃珠,在高速振蕩器上振蕩,約 5min。
2、加入 20ul 的蛋白酶 K(10mg/ml),充分混勻,55℃水浴消化 30min,消化期間可顛倒離心管混勻數(shù)次。12000rpm離心 2min。將上清轉(zhuǎn)移到一個新的離心管中。如有沉淀,可再次離心。
3、在上清中加入 200ul 溶液 B,充分混勻。如出現(xiàn)白色沉淀,可放 55℃水浴 5min,沉淀即會消失,不影響后續(xù)實驗。如溶液未變清亮,說明樣品消化不徹底,可能導致提取的 DNA 量少及不純,還有可能導致上柱后堵柱子,請增加消化時間。
4、再加入 200ul 無水乙醇,充分混勻,此時可能會出現(xiàn)絮狀沉淀,不影響 DNA 的提取,將溶液和絮狀沉淀都加入吸附柱中,放置 2 分鐘。
5、12000rpm 離心 1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
6、向吸附柱中加入 600ul 漂洗液(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12000rpm 離心 1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
7、向吸附柱中加入 600ul 漂洗液,12000rpm 離心 1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
8、12000rpm 離心 2min,將吸附柱置于室溫或 50℃溫箱放置數(shù)分鐘,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,否則漂洗液中的乙醇會影響后續(xù)的實驗如酶切、PCR 等。
9、將吸附柱放入一個干凈的離心管中,向吸附膜中央懸空滴加 50-200ul 經(jīng) 65℃水浴預熱的洗脫液,室溫放置 5min,12000rpm 離心 1min。
10、離心所得洗脫液再加入吸附柱中,室溫放置 2min,12000rpm 離心 2min,即可得到高質(zhì)量的基因組 DNA。
注意事項:
1. 由于真菌種類萬千,對于一些特別難處理的真菌,可用液氮研磨,再用玻璃珠振蕩,蛋白酶 K 處理,一般都可以得到一定量的基因組 DNA,如電泳檢測很弱,一般 PCR 都會有較好結(jié)果。
2. 若溶液 A 或溶液 B 中有沉淀,可在 55℃水浴中重新溶解。
3. 如果 DNA 提取量很少,可加長玻璃珠處理時間,如果提取 DNA 成彌散短條帶,可減少玻璃珠處理時間。
4. 洗脫緩沖液的體積不少于 50ul,體積過小會影響回收效率;洗脫液的 pH 值對洗脫效率也有影響,若需要用水做洗脫液應保證其 pH 值在 8.0 左右(可用 NaOH 將水的 pH 值調(diào)至此范圍),pH 值低于 7.0 會降低洗脫效率;DNA 產(chǎn)物應保存在-20℃,以防 DNA 降解。
5. DNA 濃度及純度檢測:得到的基因組 DNA 片段的大小與樣品保存時間、操作過程中的剪切力等因素有關(guān)。回收得到的 DNA 片段可用瓊脂糖