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藥物篩選之必備武器——化合物庫
發(fā)布日期:2018/10/9 15:01:41發(fā)布人:上海陶術(shù)生物科技有限公司

       眾所周知,藥物篩選是發(fā)現(xiàn)藥物先導(dǎo)化合物的重要途徑,而好的化合物庫則是藥物篩選的必備武器。什么是化合物庫呢?化合物庫是由特定結(jié)構(gòu)或功能的實體化合物及其相關(guān)信息在某種特定的標(biāo)準(zhǔn)下組成的集合,通常作為新藥發(fā)現(xiàn)或者細(xì)胞誘導(dǎo)的工具來使用,幫助科學(xué)家找到新藥研發(fā)的苗頭化合物或者細(xì)胞特定功能的實現(xiàn)者。

化合物庫歸類的方法多種多樣,根據(jù)其性質(zhì)和來源,市面上的化合物庫分為如下三大類:生物活性化合物庫,天然產(chǎn)物化合物庫和類藥多樣性化合物庫。下面就每一類進(jìn)行詳細(xì)介紹:

• 生物活性化合物庫:市面上普遍使用的生物活性化合物庫涵蓋了4萬種生物活性已知的小分子,其中有些是已上市或臨床期的藥物;有些是經(jīng)典的有明確靶點的活性小分子;有些是初步文獻(xiàn)報道表現(xiàn)出良好生物學(xué)活性的化合物。這些小分子可用于藥物功能重定位、細(xì)胞誘導(dǎo)、藥理研究、靶點確認(rèn)等,屬于每個藥物篩選平臺建立之初的基本配套產(chǎn)品。舉例來說,TargetMol的一套近兩千種的上市藥物庫就包含了市場上可以收集的各類疾病對應(yīng)的化學(xué)藥物,其生物活性多樣性和化學(xué)結(jié)構(gòu)多樣性都非常高,是一套性價比非常好的入門庫。同時,該類庫中還有很多廣受好評的經(jīng)典化合物庫,如:FDA上市藥物庫,臨床藥物庫,抗腫瘤庫,生物活性經(jīng)典庫和生物活性新穎庫等。

• 天然產(chǎn)物庫:天然產(chǎn)物來源豐富,取自植物,動物和微生物的細(xì)胞、組織或分泌物,種類繁多,結(jié)構(gòu)多樣,含有糖類、糖苷類、苯丙素類、醌類、黃酮類、萜類、類固醇類、生物堿類、酚類、酸類和醛類,是制藥行業(yè)獲得先導(dǎo)化合物的重要來源,常用作高通量篩選或計算機輔助藥物設(shè)計。

• 類藥多樣性化合物庫:目前世界上商品化的化合物有5000萬個,精選質(zhì)量可靠,類藥多樣性好的產(chǎn)品組成類藥多樣性化合物庫,是多達(dá)數(shù)百萬個小分子化合物的集合,是科學(xué)研究、新的藥物靶點篩選的有效工具,是高通量篩選(HTS),高內(nèi)涵篩選(HCS)和計算機虛擬篩選的不二選擇。這些產(chǎn)品一次可以為高通量篩選的平臺提供1萬到20萬個性價比很高的類藥化合物庫,非常適合用于建設(shè)高通量篩選化合物庫平臺。

除了高通量篩選的化合物庫以外,還有基于CADD(Computer Aided Drug Design)得到的各種潛在藥物靶點庫,如GPCR靶點庫,CNS靶點庫,抗菌庫,抗炎庫,抗HIV庫等。此外,一些特色化合物庫以其自身的性質(zhì)特點為廣大藥物研發(fā)科學(xué)家提供了針對性很強的研究工具,包括片段庫、大環(huán)庫、靶向共價抑制劑庫等。比如近幾年很熱門的片段庫,其合理使用可以大大提高藥物篩選的結(jié)構(gòu)覆蓋范圍,可用作基于片段篩選,科研人員可以根據(jù)其研究目標(biāo)和方法進(jìn)行單獨選擇,構(gòu)建適合的片段大小和組成;而大環(huán)庫則包含了通常定義為包含超過12個碳原子或其他重原子的環(huán)結(jié)構(gòu),與等分子量的無環(huán)分子相比,大環(huán)化降低了分子整體極性并增強了膜的滲透性,可用于篩選某些挑戰(zhàn)靶點的先導(dǎo)化合物;靶向共價抑制劑是合理設(shè)計的抑制劑,這類抑制劑具有低化學(xué)反應(yīng)性的成鍵官能團(tuán),其在與靶蛋白結(jié)合后,與靶位點上的特定親核殘基快速成鍵,因此具有較高的選擇性。

除了現(xiàn)有的化合物庫之外,完美契合客戶需求的定制化合物庫也廣受歡迎。你不僅可以選擇需要的產(chǎn)品形式如粉末、溶液;還可以選擇包裝瓶或96孔板,甚至可以從產(chǎn)品的性質(zhì)進(jìn)行選擇,如上市且具有抗腫瘤活性的藥物等。

有需要上述化合物庫數(shù)據(jù)的或關(guān)于化合物庫有更多疑問的筒子們,歡迎撥打熱線電話4008212233或QQ43172088、mail:info@targetmol.com咨詢~


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