北大劉濤/地大婁筱叮團(tuán)隊(duì)Nat. Chem.:可遺傳編碼新型熒光分子工具,助力人造熒光蛋白與生物傳感器高效構(gòu)建
熒光技術(shù)是分子生物學(xué)研究中的核心工具,尤其是熒光蛋白(如綠色熒光蛋白GFP),憑借其可遺傳編碼性、豐富的色彩變化和出色的穩(wěn)定性,為研究生物分子的定位、相互作用及動(dòng)態(tài)行為提供了強(qiáng)有力的支持。然而,傳統(tǒng)的熒光蛋白仍面臨一些顯著挑戰(zhàn):它們的分子體積較大(通常超過(guò)20 kDa),需要與目標(biāo)蛋白進(jìn)行末端融合,且可能干擾蛋白的天然功能和定位。此外,傳統(tǒng)的熒光傳感器多依賴于融合標(biāo)記蛋白或熒光染料,這些方法在活細(xì)胞環(huán)境中的適應(yīng)性和信噪比往往不佳,限制了其廣泛應(yīng)用。
針對(duì)這些瓶頸,受到熒光蛋白發(fā)色團(tuán)化學(xué)特性的啟發(fā),北京大學(xué)藥學(xué)院天然藥物及仿生藥物全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室劉濤教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中國(guó)地質(zhì)大學(xué)(武漢)婁筱叮教授團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了一類(lèi)熒光分子轉(zhuǎn)子型氨基酸(Fluorescent Molecular Rotor Amino-acid, FMR-AA)。通過(guò)結(jié)合遺傳密碼子擴(kuò)展技術(shù),該團(tuán)隊(duì)成功將 FMR-AA 以點(diǎn)突變的形式引入目標(biāo)蛋白。這一全新策略融合了熒光蛋白的可遺傳編碼優(yōu)勢(shì)與化學(xué)染料分子的微型化和拓展性,不僅能簡(jiǎn)便高效地構(gòu)建各種人造熒光蛋白,還能開(kāi)發(fā)出高靈敏度的生物傳感器,是生物成像和分子檢測(cè)技術(shù)的新突破。相關(guān)研究論文近日發(fā)表在國(guó)際著名學(xué)術(shù)期刊Nature Chemistry 上。
FMR-AA擁有一種特別的“隱身”能力。在溶液中,它保持非熒光狀態(tài),一旦進(jìn)入高粘度環(huán)境或折疊成熟后的蛋白質(zhì)中,它便能被激發(fā)出明亮的熒光。因此,該研究團(tuán)隊(duì)突破了傳統(tǒng)熒光蛋白的β-桶結(jié)構(gòu)限制,將FMR-AA引入到任意天然蛋白質(zhì)中,并通過(guò)蛋白進(jìn)化和篩選,成功獲得了具有和GFP相同熒光原理的全新熒光蛋白。這些人造熒光蛋白在結(jié)構(gòu)和尺寸上展現(xiàn)出多樣性,其中最小的結(jié)構(gòu)僅為 7 kDa。隨后,他們還在細(xì)菌和哺乳動(dòng)物細(xì)胞中驗(yàn)證了這些人造熒光蛋白免洗的動(dòng)態(tài)成像能力,為生物成像技術(shù)打開(kāi)了新的大門(mén)。
經(jīng)典的遺傳編碼熒光蛋白生物傳感器通常依賴于復(fù)雜的構(gòu)建方法,如循環(huán)重排熒光蛋白(Cp-FP)或利用兩個(gè)融合熒光蛋白之間的 FRET 效應(yīng)。這些方法往往需要繁瑣的接頭序列篩選和優(yōu)化,耗時(shí)且挑戰(zhàn)重重。而 FMR-AA 的微環(huán)境敏感性為生物傳感器的開(kāi)發(fā)提供了一條簡(jiǎn)便且高效的新路徑。該團(tuán)隊(duì)利用FMR-AA成功開(kāi)發(fā)了多種蛋白質(zhì)熒光生物傳感器,能夠?qū)崟r(shí)監(jiān)測(cè)蛋白質(zhì)構(gòu)象變化、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用以及細(xì)胞內(nèi)代謝物的動(dòng)態(tài)變化。例如,他們將FMR-AA引入到鈣調(diào)蛋白(CaM)的關(guān)鍵位點(diǎn),經(jīng)過(guò)簡(jiǎn)單的改進(jìn)和優(yōu)化,成功構(gòu)建了一種高信噪比、快速響應(yīng)的鈣離子傳感器。這款傳感器能夠在哺乳動(dòng)物活細(xì)胞中實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)鈣離子濃度的動(dòng)態(tài)變化。利用這一通用策略,該團(tuán)隊(duì)還設(shè)計(jì)了可以靈敏檢測(cè)葡萄糖、GTP和谷氨酰胺濃度的熒光傳感器,拓展了FMR-AA在生物檢測(cè)中的應(yīng)用。此外,該團(tuán)隊(duì)還展示了FMR-AA作為動(dòng)態(tài)探針檢測(cè)蛋白質(zhì)相互作用的獨(dú)特能力。還展示了FMR-AA用作檢測(cè)蛋白質(zhì)相互作用的動(dòng)態(tài)探針的能力。他們將FMR-AA引入到 FRB 和 FKBR 這兩種經(jīng)典的相互作用蛋白的結(jié)合界面,通過(guò)熒光信號(hào)的變化實(shí)現(xiàn)了對(duì)這兩種蛋白質(zhì)相互作用過(guò)程的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。該方法在體外抗原抗體相互作用和活細(xì)胞水平蛋白質(zhì)互作上均表現(xiàn)出極高的靈敏度,為分子生物學(xué)中的蛋白質(zhì)互作研究提供了更為精確和高效的檢測(cè)手段。
綜上所述,該研究在技術(shù)上突破了傳統(tǒng)熒光蛋白和生物探針開(kāi)發(fā)方法的局限,展現(xiàn)了小型化、靈活性和簡(jiǎn)便性的優(yōu)勢(shì),同時(shí)具有廣泛的適用性和優(yōu)異的信噪比,尤其在活細(xì)胞動(dòng)態(tài)觀測(cè)中表現(xiàn)出色。這項(xiàng)技術(shù)不僅推動(dòng)活細(xì)胞成像、生物分子互作研究及代謝物檢測(cè)等領(lǐng)域的發(fā)展,還為分子可視化工具的定制化開(kāi)發(fā)開(kāi)辟了新的方向。隨著技術(shù)的不斷完善,F(xiàn)MR-AA有望為揭示復(fù)雜生命過(guò)程提供更加高效、易用的研究工具,為生命科學(xué)研究帶來(lái)新的突破。
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