基因敲除（knockout）是指一種遺傳工程技術(shù)，針對某個序列已知但功能未知的序列，改變生物的遺傳基因，令特定的基因功能喪失作用，從而使部分功能被屏蔽，并可進一步對生物體造成影響，進而推測出該基因的生物學(xué)功能。

當(dāng)前一些基因組改造新方法在科學(xué)界引發(fā)了廣泛的討論：例如，采用CRISPR/Cas技術(shù)，科學(xué)家們可以刪除某一基因遺傳密碼的組成部分，由此敲除掉這一基因。此外，還有一些方法可以抑制基因翻譯為蛋白質(zhì)。兩種方法的共同之處在于，它們都阻礙了蛋白質(zhì)生成，因此可給生物體造成一些相似的影響。然而，有證據(jù)顯示敲除或是阻斷基因有可能會造成不同的后果。 來自馬克斯普朗克心臟與肺研究所的科學(xué)家們現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)，有其他的基因補償敲除的基因從而降低影響或是完全彌補缺陷。研究結(jié)果表明，在解讀來自分子生物學(xué)研究的數(shù)據(jù)或開發(fā)基因療法治療各種疾病時需持謹慎的態(tài)度。

基因敲除是自80年代末以來發(fā)展起來的一種新型分子生物學(xué)技術(shù)，是通過一定的途徑使機體特定的基因失活或缺失的技術(shù)。通常意義上的基因敲除主要是應(yīng)用DNA 同源重組原理，用設(shè)計的同源片段替代靶基因片段，從而達到基因敲除的目的。隨著基因敲除技術(shù)的發(fā)展，除了同源重組外，新的原理和技術(shù)也逐漸被應(yīng)用，比較成功的有基因的插入突變和iRNA ，它們同樣可以達到基因敲除的目的。

基因敲除亦稱基因剔除。依據(jù)DNA同源重組原理建立，用以推測基因功能的技術(shù)。該技術(shù)對一個結(jié)構(gòu)已知但功能未知的基因，從分子水平上設(shè)計實驗，應(yīng)用基因打靶方法，將該基因完全去除、修飾或用其他序列相似基因取代，然后從整體觀察實驗動物，推測相應(yīng)的基因功能?；蚯贸齽游锬Ｐ捅粡V泛地應(yīng)用于研究與營養(yǎng)素代謝、生物轉(zhuǎn)化和生物學(xué)功能相關(guān)的基因及其功能，以及營養(yǎng)失調(diào)相關(guān)疾病的發(fā)病機制等。