質(zhì)粒小量抽提試劑盒

信裕生物的質(zhì)粒小量抽提試劑盒(Plasmid Mini Preparation Kit, Plasmid Miniprep Kit)是一種用于從大腸桿菌中進(jìn)行小量質(zhì)?？焖俪樘岬碾x心柱式試劑盒。
本試劑盒適用于常用的EndA^-菌株DH5α、JM109和XL-1 blue等。對(duì)于EndA⁺菌株如JM110、BL21(DE3)、TG1和HB101等，可以順利完成質(zhì)粒抽提，但從EndA⁺菌株中抽提獲得的質(zhì)粒會(huì)有輕微的核酸酶污染，如果在內(nèi)切酶緩沖液中37℃孵育1小時(shí)會(huì)導(dǎo)致質(zhì)粒全部降解。從EndA⁺菌株中抽提質(zhì)粒時(shí)推薦使用信裕生物的D0007S/D0007M 質(zhì)粒小量抽提試劑盒(通用型)、D0020 質(zhì)粒中量抽提試劑盒(通用型)和D0028 質(zhì)粒大量抽提試劑盒(通用型)。
野生型大腸桿菌中表達(dá)Endonuclease I，能切割并降解雙鏈DNA。編碼Endonuclease I的基因是endA，如果endA突變失活，其基因型會(huì)被標(biāo)注為endA1，相應(yīng)的突變菌株被稱(chēng)為EndA^-菌株，而野生型菌株則被稱(chēng)為EndA⁺菌株。常見(jiàn)的EndA^-和EndA⁺菌株參見(jiàn)附表1。從EndA⁺菌株中抽提的質(zhì)粒，微量核酸酶和質(zhì)粒結(jié)合而容易被共純化，導(dǎo)致容易降解。
本試劑盒采用了一種新型的離子交換柱。在特定條件下，使質(zhì)粒能在離心過(guò)柱的瞬間，結(jié)合到質(zhì)粒純化柱上，在一定條件下又能將質(zhì)粒充分洗脫，從而實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒的快速純化。無(wú)需酚氯仿抽提，無(wú)需酒精沉淀，12個(gè)樣品只需不足30分鐘即可完成。
每個(gè)質(zhì)粒純化柱可以結(jié)合的質(zhì)粒量的上限約為20微克。每個(gè)純化柱可用于抽提1-5毫升用LB培養(yǎng)過(guò)夜的大腸桿菌。抽提所得質(zhì)粒的OD260和OD280比值一般在1.80左右。抽提獲得的質(zhì)粒量會(huì)受質(zhì)粒拷貝數(shù)等因素影響。抽提獲得的質(zhì)粒DNA的OD260和OD280比值也會(huì)因菌種不同等原因而略有波動(dòng)。
本試劑盒抽提所得到的質(zhì)?？芍苯佑糜谵D(zhuǎn)染細(xì)胞，DNA測(cè)序，PCR，基于PCR的突變，體外轉(zhuǎn)錄，轉(zhuǎn)化細(xì)菌，內(nèi)切酶消化等。
包裝清單：

保存條件：
室溫保存，一年有效。
注意事項(xiàng)：
次使用前把試劑盒提供的RNase A全部加到溶液I (懸浮液)中，混勻，并在瓶上做好標(biāo)記。加入RNase A后4℃存放。
次使用前在每瓶溶液IV (洗滌液)中加入54ml無(wú)水乙醇，混勻，并在瓶上做好標(biāo)記。
溫度較低時(shí)，溶液II和溶液III可能會(huì)有沉淀產(chǎn)生。使用前必須檢查一遍。如有沉淀，37℃水浴加熱溶解，混勻后使用。溶液II請(qǐng)勿過(guò)分劇烈混勻，否則會(huì)產(chǎn)生大量氣泡。
溶液II使用完后，一定要蓋緊瓶蓋，防止被空氣中二氧化碳酸化。
溶液II有強(qiáng)堿性，溶液II、溶液III和溶液IV對(duì)人體有刺激性，操作時(shí)請(qǐng)小心，并注意適當(dāng)防護(hù)以避免直接接觸人體或吸入體內(nèi)。
本試劑盒所有操作均在室溫進(jìn)行，操作時(shí)無(wú)需冰浴。所有離心也均在室溫進(jìn)行。
廢液收集管在一次抽提中需多次使用，切勿中途丟棄。
本產(chǎn)品僅限于專(zhuān)業(yè)人員的科學(xué)研究用，不得用于臨床診斷或治療，不得用于食品或藥品，不得存放于普通住宅內(nèi)。
為了您的安全和健康，請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。

使用說(shuō)明：
1. 取過(guò)夜菌1.5毫升，5000g離心1分鐘收集細(xì)菌沉淀，棄上清。再重復(fù)一次，每管共收集3毫升過(guò)夜菌沉淀。
通常大腸桿菌宜用LB培養(yǎng)過(guò)夜(16小時(shí)左右)至OD值為2-4。建議5000g(通常為5000rpm左右)室溫離心1分鐘，如沉淀不充分則適當(dāng)延長(zhǎng)離心時(shí)間。時(shí)間過(guò)長(zhǎng)或離心速度過(guò)快會(huì)使沉淀過(guò)于緊密，不利于加入溶液I后散開(kāi)沉淀。直接倒掉上清，再倒入約1.5毫升菌液并重復(fù)上述操作，然后倒置于吸水紙上(可用普通草紙)，使液體流盡。如果細(xì)菌密度明顯偏低，可考慮使用更多菌液，再重復(fù)上述操作1-2次。對(duì)于高拷貝質(zhì)粒所用菌量一般不能超過(guò)5毫升，對(duì)于低拷貝質(zhì)粒所用菌量一般不能超過(guò)10毫升。過(guò)量的細(xì)菌會(huì)導(dǎo)致后續(xù)的裂解不充分。
2. 每管加入250微升溶液I，重懸細(xì)菌沉淀。確保沉淀完全散開(kāi)，無(wú)可見(jiàn)細(xì)菌團(tuán)塊。
確認(rèn)溶液I中已經(jīng)添加了RNase A。最高速度vortex 5-10秒或更長(zhǎng)時(shí)間，懸起沉淀。一定要充分混勻，對(duì)著光亮處觀察應(yīng)呈均勻的懸濁液，無(wú)明顯細(xì)菌團(tuán)塊或絮塊。如果沒(méi)有vortex，可以用槍吹打沉淀使沉淀逐漸散開(kāi)或用手指把沉淀彈開(kāi)。
3. 每管加入250微升溶液II，輕輕顛倒離心管4-6次，使細(xì)菌完全裂解，溶液透明。
切勿vortex！vortex或其它劇烈操作會(huì)導(dǎo)致基因組DNA斷裂，易導(dǎo)致最終所得質(zhì)粒被基因組DNA污染。顛倒4-6次后，溶液應(yīng)變得透明，無(wú)團(tuán)塊或絮狀物。如果加入溶液I后細(xì)菌沒(méi)有完全散開(kāi)，那么顛倒4-6次后，可能還會(huì)有團(tuán)塊或絮狀物。遇到有少量團(tuán)塊或絮狀物產(chǎn)生的情況，可以增加顛倒次數(shù)3-5次，再室溫放置2-3分鐘，但總裂解時(shí)間不可超過(guò)5分鐘。
4. 每管加入350微升溶液III，隨即顛倒離心管4-6次混勻，可見(jiàn)白色絮狀物產(chǎn)生。
切勿vortex！顛倒次數(shù)也不宜過(guò)多，否則易導(dǎo)致最終所得質(zhì)粒的質(zhì)量下降。
5. 最高速(13,000rpm左右)室溫離心10分鐘。
離心后會(huì)產(chǎn)生白色沉淀。離心時(shí)準(zhǔn)備好下一步需使用的質(zhì)粒純化柱，廢液收集管，并在純化柱上做好標(biāo)記。
6. 將上一步驟離心后的上清倒入或吸入到質(zhì)粒純化柱內(nèi)。最高速離心30-60秒，倒棄收集管內(nèi)液體。
質(zhì)粒倒入質(zhì)粒純化柱后，可以不用等待，直接離心。倒棄收集管內(nèi)的液體后，保留收集管繼續(xù)使用。
7. 在質(zhì)粒純化柱內(nèi)加入750微升溶液IV，最高速離心30-60秒，洗去雜質(zhì)，倒棄收集管內(nèi)液體。
加入溶液IV后可以不用等待，直接離心。倒棄收集管內(nèi)的液體后，保留收集管繼續(xù)使用。
8. 再最高速離心1分鐘，除去殘留液體并使痕量乙醇完全揮發(fā)。
注意：倒棄收集管內(nèi)液體后再離心，才能徹底去除微量的溶液IV。微量的溶液IV會(huì)影響質(zhì)粒的質(zhì)量。
9. 將質(zhì)粒純化柱置于潔凈1.5毫升離心管上，加入50微升溶液V至管內(nèi)柱面上，放置1分鐘。
溶液V需要直接加至管內(nèi)柱面中央，使液體被純化柱吸收。如果不慎將溶液V沾在管壁上，一定要震動(dòng)離心管，使液體滑落到管底，以便被純化柱吸收。也可以用重蒸水或Milli-Q級(jí)純水替代溶液V，但是水的pH應(yīng)不小于6.5。溶液V加入后放置時(shí)間稍長(zhǎng)，對(duì)于增加質(zhì)粒產(chǎn)量會(huì)略有幫助。如想得到較高濃度的質(zhì)粒，可以加入35微升溶液V洗脫。
10. 最高速離心1分鐘，所得液體即為高純度質(zhì)粒。
通常所得質(zhì)粒濃度為0.1-0.3mg/ml左右。如果想得到高濃度的質(zhì)粒，可以采用常規(guī)的乙醇沉淀方法濃縮質(zhì)粒。
附表1. EndA^- and EndA⁺ strains of E. coli.