隨著離子色譜日益廣泛的應用，許多樣品已經無法用傳統(tǒng)的方法采用采樣、稀釋、過濾后直接進樣的模式來進行離子色譜的分析。對于大量復雜基體的樣品，離子色譜可以采用合適的方法，通過預處理后再用離子色譜法進行分析，這樣一方面可以解決樣品復雜基體對離子色譜柱的沾污，另一方面也可以大大提高以復雜基體樣品測定結果和準確性、提高分析方法的靈敏度。
有關樣品預處理方法，隨著國內離子色譜的用戶水平的提高，出現了大量相關離子色譜的預處理方法，這些方法有如下幾方面的特點：(1)大部分樣品前處理方面，采用國產材料進行，預處理的成本很低，更能適合于中國國情，可以在國內廣泛推廣使用；(2)大部分樣品預處理方法采用離線方法，不需要昂貴的在線設備；但相對而言，樣品處理的時間比較長，需要的樣品量也比較多一些，在目前自動進樣器還沒有國內廣泛應用的今天，這些方法是比較實用的；(3)與國際上出現的一些樣品預處理方法，國內出現的樣品前處理絕大多數均出自于基層單位，實用性強；但卻相關的理論方面的探討比較少。因此，許多國內采用樣品前處理方法，一方面可以再進一步從理論角度進行討論，另一方面也可以通過適當改進配合包括國內和國外的儀器用于在線樣品的預處理。
最常用的樣品前處理技術比較
微膜過濾固相萃取技術透吸和滲吸技術
使用和生產的廠家所有HPLC和離子色譜廠家所有HPLC,GC和離子色譜廠家很少廠家仍在使用。
使用的材質0.22um聚砜或尼龍膜C18/RP反相/離子交換/螯合樹脂填料0.2um醋酸纖維膜有機溶劑兼容性兼容兼容不兼容分析結果的準確性很好?？繅毫ΡＷC分析的組份能夠全部通過，沒有損失。很好?？繅毫ΡＷC分析的組份能夠全部通過，沒有損失。不同樣品和不同組份在膜上擴散系數和平衡速率的不同，所以很難保證分析結果的準確度、重復性和回收率。
使用的領域廣泛應用于IC/HPLC等色譜分析領域廣泛應用于IC/HPLC/GC等色譜分析領域在生命科學領域廣泛用于蛋白或多肽的脫鹽和去除小份子雜質。很少用于色譜分析方面。
適用范圍僅用于去除顆粒物污染。使用簡單，價格便宜。適用于90%以上離子色譜分析樣品。無需增加專用設備既可以實現手動或自動在線使用。適用于各種樣品和污染物，是目前的離子色譜樣品前處理技術。使用簡單。無需增加專用設備既可以實現手動或自動在線使用。不同樣品可采用不同的萃取柱來完成。僅適合于去除分子量大于300萬道爾頓的生物有機污染物。不能截留大多數小分子有機物(如油脂，糖，色素，腐質酸等)，實際使用意義很小。需配置專用裝置(如蠕動泵，切換閥等)才能實現自動在線使用，使用成本很低，已經國產化，平均1元/樣品低，已經國產化，價格十分便宜。很昂貴，裝置價格大約14000USD。消耗品必須使用進口專用膜。
處理樣品時間快，一般在幾秒鐘內快，一般在幾秒鐘內慢，需要十幾到幾十分鐘，有機物(有機酸、有機胺、糖、氨基酸等)測定的適用性均能適用不同的分析對象可以選擇合適的萃取柱平衡時間太長，基本上無法用于離子色譜，也未見相關的報導。
產品的通用性各廠家產品可以互用各廠家產品可以互用通用性差
由于離子色譜分析特殊性，對于離子色譜經典的方法有堿熔法、干式灰化法、氧瓶/氧彈燃燒法、水蒸氣蒸餾法、高溫熱解等，丁曉靜和牟世芬等就離子色譜的樣品前處理的新技術進行綜述，對國內外在這方面的最新研究進展作了介紹。本文從膜處理法、固相萃取處理法、分解處理法等幾種不同類型，分別加以討論。
1.膜處理法
1.1.濾膜或砂芯處理法
濾膜過濾樣品是離子色譜分析最通用的水溶液樣品前處理方法，一般如果樣品含顆粒態(tài)的樣品時，可以通過0.45或0.22μm微孔濾膜過濾后直接進樣。由于一般的濾膜不能耐高壓，因此濾膜過濾只能用于離線樣品處理。有時需要在線樣品處理，或者將該方法用于儀器管路中，必須采用砂芯濾片。但濾膜過濾方法只能去除顆粒態(tài)不溶性物質，對于極小顆?；蛴袡C大分子可溶性化合物和金屬水溶性離子，照樣能夠進入色譜柱干擾樣品的測定并沾污色譜柱。
此外，除非濾膜或砂芯是為離子色譜分析所特別設計的，濾膜或砂芯中均會含有一定量的無機陰、陽離子，這類離子的存在對水溶液中痕量的陰、陽離子分析會產生干擾，影響測定的準確性。因此，對于痕量離子分析時，建議在測定樣品前用二次去離子水對濾膜進行多次洗滌，并注射空白樣品，測定時進行空白背景扣除。宣棟梁對［4］國產四種不同水相濾膜水洗后殘留陰離子進行了比較，發(fā)現次進樣時，各廣家生產的濾膜均發(fā)現含有mg/L級數量的陰離子，用淋洗液經5次以上洗滌后，濾膜上大部分陰離子被洗脫，陰離子的含量基本上趨于穩(wěn)定，因此，可以通過空白試驗對樣品進行測定。
由于濾膜處理法的局限性，國外曾有人嘗試采用滲析法和超濾法，由于滲析法所需要的平衡時間比較長，而超濾所需的成本比較高，而對污染物的去除率并不徹底。最近有公司宣傳的"英藍"技術其原理就是使用滲透膜或超濾膜技術處理樣品。在IC中使用的滲透或超濾膜只能用醋酸纖維材料做,因為其對蛋白的吸附比較低.而其他抗有機溶劑的材料如硝酸纖維膜和尼龍膜對蛋白質的吸附性高,如果使用會影響分析的重復性和膜的使用壽命.但是醋酸纖維膜的缺點是:1.只能使用水和乙醇,不能兼容強有機溶劑(會溶解),所以不耐正相和反相溶劑;2.萬通使用的膜為0.2u(大約是300萬分子量大小)不能截留大多數小分子有機物,只能截留分子量達到300萬道爾頓很大的物質如懸浮顆粒,大分子蛋白等.實際IC樣品中大量存在的是小分子有機物如腐質酸,脂肪,油污等等,這些物質無法用滲透或超濾膜去除.如牛奶樣品,只有絡蛋白可以用所謂"英藍"技術去除,而大量的脂肪和其他小分子有機物缺無法解決.所以這一技術其使用效果并不好而且很有限,只是起到一般過濾的作用.如果用戶不了解這些信息,只是相信商業(yè)宣傳,實際使用后會發(fā)現使用"英藍"技術處理樣品后反而其分析柱的使用壽命會縮短,因為大量"英藍"技術無法去除的小分子有機物會進入分析柱.使用滲透或超濾膜技術的另外問題是需要外加蠕動泵循環(huán)加壓,使的儀器的機構變復雜,故障率高,使用麻煩和成本高(如膜的更換,蠕動泵硅膠管的更換,泵的維護等等)
1.2.電滲析處理法
而在國內比較的特色的工作是采用電滲析法，與其它的膜處理方法相比，電滲析處理法有一定的選擇性，因此不僅可以有效去除顆粒物、有機污染物，而且也可以去除重金屬離子的污染物。是處理復雜基體樣品最有效的方法之一。
1.3.電解中和法
與電滲析法相比，電化學電解中和器利用水電解中和所產生氫離子或氫氧根離子可以對高濃度酸和堿進行中和處理。本實驗室利用國產的電化學自再生抑制器，讓高濃度的堿通過中和器，而外加水電解抑制的離子色譜的電導池餾分作為中和器外加水電解作為再生液。只要濃度足夠低，就可以實現對高濃度堿中痕量陰離子的分析，類似方法也可以實驗高濃度酸中痕量陽離子的分析。與國外商品化的中和器相比，我們自己構造的中和器可以在任何類型的離子色譜儀上采用，而且整個裝置只有進口設備價格的1/40。
2.固相萃取法
固相萃取是國內離子色譜樣品前處理應用最廣泛的一種方法，對不同的溶液中的污染物，可以分別利用反相、離子交換、螯合樹脂等多種手段進行，從而萃取手段上也可以利用常規(guī)的固相萃取法和固相微萃取法，但固相微萃取法一般是利用了在液相色譜上樣品濃縮和去除基體干擾的反過程，因此固相微萃取法用于離子色譜中，更為方便，而且一個固相微萃取柱可以多次使用。