3,6-二氯吡嗪-2-甲腈可用于生產(chǎn)Favipiravir（F103350），該藥物用于在小動物模型中治療晚期埃博拉病毒感染。

3，6-二氯吡嗪-2-甲腈可用作醫(yī)藥合成中間體，可由2-氰基吡嗪為反應原料制備中間體3，6-二氯吡嗪-2-甲腈，進一步與三氯氧磷反應得到3，6-二氯吡嗪-2-甲腈。3，6-二氯吡嗪-2-甲腈可用于3，6-二氟-2-氰基吡嗪的制備。

3，6-二氯吡嗪-2-甲腈的制備：

1)1.4-二氧吡嗪酰胺的制備：控制溫度-5～5℃，將2-氰基吡嗪5.25g與冰乙酸29.95g、30％的雙氧水45.30g混合均勻，升溫至95℃，回流反應22h，TLC顯示無原料后，40℃減壓旋蒸除去溶劑，加入15ml水，減壓旋蒸，重復數(shù)次除去冰乙酸后加入15ml水，加入熱的氯仿萃取(15ml*3)，水層減壓旋干，90％甲醇重結晶，過濾，濾餅真空干燥得白色粉末狀1，4-二氧吡嗪酰胺4.45g，熔點大于300℃，收率57.43％。

2）將1.4-二氧吡嗪酰胺6.20g加入到重蒸后的三氯氧磷24.53g中混合均勻，50℃攪拌50min中，升溫至70℃反應1h，冷卻至室溫，再加入三乙胺4.86g，加畢升溫至96℃，回流反應6h，TLC顯示反應完完成后，減壓旋干，沖入10mL冰水，乙酸乙酯(15mL*3)萃取，合并有機相，飽和食鹽水洗滌2次，有機相經(jīng)無水硫酸鈉干燥后過濾，濾液減壓旋干，柱色譜純化分離后經(jīng)真空干燥得淡黃色固體3，6-二氯吡嗪-2-甲腈3.14g，收率45.15％，熔點90-91℃。

3,6-二氯吡嗪-2-甲腈是生產(chǎn)法匹拉韋中間體。
法匹拉韋，是由日本富士膠卷富山化學研制（中國授權方“浙江海正藥業(yè)”），該藥物于2014年3月在日本批準上市，用于甲型、乙型流感的抗病毒治療。研究表明除流感病毒外，該藥還對多種RNA病毒展現(xiàn)出良好的抗病毒作用，如埃博拉病毒、沙粒病毒、布尼亞病毒、狂犬病毒等。
法匹拉韋是一種新型廣譜抗RNA病毒藥物，能夠選擇性抑制與病毒復制相關的RNA聚合酶，可被宿主細胞酶磷酸核糖基化生成具有生物活性的法匹拉韋RTP；法匹拉韋RTP被病毒RNA聚合酶錯誤識別，進而插入到病毒RNA鏈中或與病毒RNA聚合酶結構域結合，從而阻礙病毒RNA鏈的復制和轉錄。魔高一尺，道高一丈，法匹拉韋不愧為“病毒克星”。
試驗證明，法匹拉韋能抑制埃博拉病毒、黃熱病、基孔肯雅病毒、諾如病毒和腸病毒，也能有效抑制耐藥(金剛烷胺、奧司他韋、扎納米韋)的流感病毒，因此被日本列入國家戰(zhàn)略儲備藥物。
研究還表明，在體外的細胞試驗中，法匹拉韋對流感病毒的IC50為341nM，對新冠病毒的EC50達到61.88μM，表明其具有非常強大的抗病毒能力。