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mRNA提取試劑盒

2020/3/22 17:05:45

背景[1-6]

mRNA提取試劑盒用于從細(xì)胞、組織、新鮮血液和病毒中提取200 bp及以下的small RNA,用LB10裂解樣品后,加入氯仿,溶液分為無色水相和粉紅色有機(jī)相,RNA在水相中;用RNA硅膠膜離心柱特異地吸附水相中的大分子量RNA(28S rRNA,18S rRNA,mRNA),流出液中的small RNA用miRNA硅膠膜離心柱特異地吸附。與其它miRNA提取方法相比,該試劑盒裂解能力強(qiáng)、提取量高、專一性強(qiáng),應(yīng)用范圍廣。

mRNA提取試劑盒包括一套用于固、液相分離的分離裝置;所述分離裝置中至少包含一層纖維素固相載體;該試劑盒還包括下述所有成份:至少有一管為細(xì)胞或組織裂解液;至少有一管為生物素化Oligo(dT)探針;至少有一管為結(jié)合緩沖液;至少有一管為洗脫緩沖液。該試劑盒操作簡(jiǎn)便、快速、高效,適合用于生物樣品中mRNA的分離提取。

其主要特征在于分離裝置中采用纖維素為固相載體,利用融合蛋白CBD-SA作為生物橋聯(lián)劑,以生物特異性偶聯(lián)法代替?zhèn)鹘y(tǒng)的物理吸附法和化學(xué)鍵合法活化纖維素固相載體,活化后的固相載體能夠高效率的結(jié)合生物素化的試劑,可用于蛋白或核酸的分離。構(gòu)建cDNA文庫(kù)、蛋白質(zhì)的體外翻譯和RT-PCR方法檢測(cè)稀有的mRNA等研究常常需要從總RNA中分離mRNA,mRNA只占總RNA的1%左右,但由于帶poly(A)尾巴,所以可以通過與Oligo(dT)的親和結(jié)合而與其RNA(如rRNA、tRNA等)分離開。

使用方法:將0.5 mL結(jié)合液加入到一管裝有1 mg Oligo(dT)纖維素的離心管中,放置5分鐘后離心吸棄上清后待用。將制備的總RNA 100μL加熱到65℃5分鐘后加入等體積的結(jié)合液,轉(zhuǎn)移到裝有Oligo(dT)纖維素的離心管中,顛倒混勻數(shù)次,離心后將上清轉(zhuǎn)移到一個(gè)離心管中。用0.5 mL結(jié)合液,混勻后4℃200 g離心5分鐘,小心棄上清。重復(fù)上步洗3-5次,用RNase-free水洗脫mRNA,用微量核酸沉淀劑沉淀回收mRNA。

mRNA提取試劑盒具有下列特點(diǎn):

1.直接從總RNA中提取mRNA,即開即用,非常方便。

2.處理量大,一次可以處理10μg總RNA。

3.操作簡(jiǎn)單,只需要離心就可以完成,免去了灌柱、洗柱等麻煩。

4.得到的mRNA可以直接用于構(gòu)建cDNA文庫(kù)、蛋白質(zhì)的體外翻譯和RT-PCR。

應(yīng)用[7][8]

mRNA提取試劑盒可用于游離mRNA的提取實(shí)驗(yàn):

在基于存在形式的人精漿游離mRNA和microRNA提取實(shí)驗(yàn)中由于精漿小體直徑大部分在0.10μm以上,本實(shí)驗(yàn)擬采用0.10μm濾膜對(duì)精漿標(biāo)本微過濾(microfiltration,MF)截留大部分精漿小體,用于提取cfs-mRNA,檢測(cè)這種基于存在形式的提取方法的提取量,同時(shí)也是對(duì)cfs-mRNA的存在形式進(jìn)行證實(shí)性研究。

收集精液參數(shù)正常的男性精液標(biāo)本,用0.10μm濾膜過濾后用TrizolLSReagent提取cfs-mRNA,通過熒光定量RT-PCR,擴(kuò)增管家基因β-actin(ACTB)、睪丸組織特異基因DDX4、PRM2、附睪特異性表達(dá)基因WFDC9、前列腺特異基因TGM4、精囊腺特異基因SERPINA5,與不過濾直接應(yīng)用TrizolLSReagent提取cfs-mRNA比較,分析0.10μm濾膜對(duì)cfs-mRNA提取含量的影響。

結(jié)果:將正常男性精漿標(biāo)本通過0.10μm濾膜后再采用TrizolLSReagent提取cfs-mRNA,與未過濾提取的mRNA比較,分別有93.9%±15.7%(Mean±SE)ACTB、99.1%±12.5%DDX4、76.9%±18.5%PRM2、88.1%±29.6%WFDC9、150.2±73.6%TGM4、98.6%±17.8%SERPINA5被提取,各基因水平均無明顯降低(P>0.05,n=6,Paird-Samplest-test)。說明大部分含cfs-mRNA的精漿小體被0.1μm濾膜截留下來,濾膜上精漿小體內(nèi)cfs-mRNA足以穩(wěn)定被檢測(cè)出。

結(jié)論:利用0.10μm濾膜對(duì)精漿小體進(jìn)行富集,進(jìn)而再提取cfs-mRNA,這種基于存在形式的提取方法,不會(huì)對(duì)cfs-mRNA量產(chǎn)生明顯降低,因此可有效的提取cfs-mRNA。且本實(shí)驗(yàn)結(jié)果與前期課題組對(duì)通過精漿小體的獲取及過濾實(shí)驗(yàn)等結(jié)果一致,表明大部分精漿小體不能通過0.10μm濾膜,同時(shí)證實(shí)cfs-mRNA主要被包裹在精漿小體中。析經(jīng)濾膜過濾后所提取的cfs-mRNA的純度和DNA污染等。

方法:分別通過未過濾直接用TrizolLSReagent提取方法,和微過濾(microfiltration,MF,直徑0.1μm)后TrizolLSReagent對(duì)留于濾膜上的精漿小體進(jìn)行裂解提取的方法,提取cfs-mRNA。通過分光光度計(jì)測(cè)定兩種方法提取的mRNA純度(OD260/280);通過毛細(xì)血管電泳對(duì)所提取的RNA片段分布進(jìn)行分析;熒光定量PCR擴(kuò)增DDX4,定量檢測(cè)兩種方法提取的cfs-mRNA中基因組DNA的殘留量。提取濾膜上及濾液中的DNA,熒光RT-PCR定量檢測(cè)DNA殘留量,并與精漿DNA總量進(jìn)行比較。

參考文獻(xiàn)

[1]Plasma MicroRNA Profiling Reveals Loss of Endothelial MiR-126 and Other MicroRNAs in Type 2 Diabetes[J].Anna Zampetaki,Stefan Kiechl,Ignat Drozdov,Peter Willeit,Ursula Mayr,Marianna Prokopi,Agnes Mayr,Siegfried Weger,Friedrich Oberhollenzer,Enzo Bonora,Ajay Shah,Johann Willeit,Manuel Mayr.Circulation Research.2010(6)

[2]A robust methodology to study urine microRNA as tumor marker:microRNA-126 and microRNA-182 are related to urinary bladder cancer[J].Merle Hanke,Kai Hoefig,Hartmut Merz,Alfred C.Feller,Ingo Kausch,Dieter Jocham,Jens M.Warnecke,Georg Sczakiel.Urologic Oncology:Seminars and Original Investigations.2010(6)

[3]MicroRNA markers for forensic body fluid identification obtained from microarray screening and quantitative RT-PCR confirmation[J].Dmitry Zubakov,Anton W.M.Boersma,Ying Choi,Patricia F.Kuijk,Erik A.C.Wiemer,Manfred Kayser.International Journal of Legal Medicine.2010(3)

[4]ADAM7 is associated with epididymosomes and integrated into sperm plasma membrane[J].Jeong Su Oh,Cecil Han,Chunghee Cho.Molecules and Cells.2009(5)

[5]Identification of forensically relevant body fluids using a panel of differentially expressed microRNAs[J].Erin K.Hanson,Helge Lubenow,Jack Ballantyne.Analytical Biochemistry.2009(2)

[6]Tumor-derived microvesicles modulate the establishment of metastatic melanoma in a phosphatidylserine-dependent manner[J].Luize G.Lima,Roger Chammas,Robson Q.Monteiro,Maria Elisabete C.Moreira,Marcello A.Barcinski.Cancer Letters.2009(2)

[7]Microarray profiling of microRNAs expressed in testis tissues of developing primates[J].Naihong Yan,Yilu Lu,Huaqin Sun,Weimin Qiu,Dachang Tao,Yunqiang Liu,Huijiao Chen,Yuan Yang,Sizhong Zhang,Xiang Li,Yongxin Ma.Journal of Assisted Reproduction and Genetics.2009(4)

[8]王立平.基于存在形式的人精漿游離mRNA和microRNA提取[D].華中科技大學(xué),2012.

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