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RNA長(zhǎng)效保存液

2020/3/22 17:05:45

背景[1-6]

RNA長(zhǎng)效保存液是一種能高效抑制RNase活性的新型小分子混合物,用于防止RNase對(duì)RNA的降解作用。組織RNA長(zhǎng)效保護(hù)液從新鮮組織細(xì)胞中提取RNA時(shí),由于各種原因若不能馬上處理樣品,即使-70℃保存樣品中的RNA也不穩(wěn)定容易降解,而液氮保存既昂貴又不方便。RNA保護(hù)液是一種無毒的樣品儲(chǔ)存液,能迅速滲入新鮮組織細(xì)胞的胞漿迅速而強(qiáng)烈滅活生物樣品中的RNA酶,抑制RNA降解。

標(biāo)本在4℃或室溫長(zhǎng)時(shí)間保存,其中的RNA不會(huì)降解,免去使用液氮或超低溫冰箱的不便,從而有效地解決了樣品保存及運(yùn)輸?shù)膯栴}。隨后可采用當(dāng)今世界上各種常見的RNA抽提試劑如RNAtrip、TRIzol或用戶自備試劑提取樣品RNA。

組織RNA長(zhǎng)效保護(hù)液使用范圍:

1.生物樣品已采集完畢,但由不可預(yù)測(cè)原因不能立即進(jìn)行RNA提取。

2.異地生物標(biāo)本保存和運(yùn)輸。如野外采集動(dòng)植物標(biāo)本,異地運(yùn)輸或郵寄標(biāo)本等。

3.沒有低溫條件或低溫設(shè)備不可用。如冰箱故障意外停電等。

4.RNase含量特別豐富的組織如胰腺或脾臟,預(yù)先用RNA保護(hù)液進(jìn)行預(yù)處理,可以獲得很好的結(jié)果。

5.珍貴樣品,取出部分RNA保護(hù)液處理過的樣品提取RNA,剩余樣品可繼續(xù)凍存于保護(hù)液中??煞磸?fù)凍融并多次取樣20次以上。

6.RNA表達(dá)分析,不同實(shí)驗(yàn)RNA表達(dá)的時(shí)序變化可立即被RNA保護(hù)液固定,減少樣品誤差。

適用:新鮮生物組織和細(xì)胞,如動(dòng)物組織、植物組織、臨床標(biāo)本、胚胎、真核細(xì)胞、血液、細(xì)菌、酵母菌,病毒等。但不能用于已經(jīng)保存冷凍組織和凍融后的組織。

產(chǎn)品特點(diǎn):

1.高效抑制RNase,保存在RNAsaver中的RNA可以在抵抗100 ng/mL的RNase A的降解作用達(dá)36小時(shí),

效果比人胎盤RNase抑制蛋白和RVC更有效。

2.耐高溫,100℃保溫30分鐘后活性不受任何影響。

3.抗氧化,不需要DTT。

4.有效pH范圍廣。

5.產(chǎn)品為淡紅色液體,可以-20℃保存兩年。

RNA長(zhǎng)效保存液將直接用于溶解RNA沉淀(跟使用RNase-free水一樣),然后放置在適當(dāng)溫度下保存(一般在-20℃)。保存在RNApreserve中的RNA可以直接電泳,不影響Northern雜交。但由于RNA保存液會(huì)抑制后續(xù)酶反應(yīng),所以如果RNA要用于RT-PCR等反應(yīng),需要預(yù)先用LiCl沉淀去除RNA保存液(將1/3倍體積的LiCl加入溶液中,4℃12000~15000g離心20-30分鐘,棄上清,用75%乙醇洗一次既得RNA沉淀)。

應(yīng)用[7][8]

RNA長(zhǎng)效保存液可用于RNA及RNA樣本的長(zhǎng)期保存:

RNA固定劑、固定時(shí)間及溫度對(duì)RNA病毒感染組織總RNA的完整性、得率及病毒RNA擴(kuò)增的影響。以及固定劑和固定時(shí)間對(duì)石蠟包埋組織中RNA降解和標(biāo)本病理形態(tài)學(xué)的影響。方法:取漢坦病毒76—118株接種乳鼠的感染組織,以沉淀脫水類固定劑100%甲醇、75%乙醇、100%丙酮以及醛類固定劑4%的多聚甲醛磷酸緩沖液(4%PFA)、10%福爾馬林共五種固定劑,分別在4℃和室溫下固定病毒感染組織6h、12h、24h和48h后,對(duì)固定后標(biāo)本進(jìn)行如下檢測(cè)或處理:

1、從固定6h~48h后的標(biāo)本中直接提取組織總RNA,用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)RNA完整性;以分光光度計(jì)測(cè)吸光度計(jì)算組織總RNA得率;用巢式RT—PCR擴(kuò)增病毒RNA序列,電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物并行灰度掃描。對(duì)RNA得率及PCR產(chǎn)物電泳所測(cè)灰度值進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。2、將固定后的病毒感染組織標(biāo)本進(jìn)行石蠟包埋長(zhǎng)期保存。對(duì)石蠟包埋組織切片后HE染色,鏡下觀察各種固定劑對(duì)組織病理形態(tài)學(xué)的影響。

從長(zhǎng)期保存的各種方式固定后石蠟包埋組織中以RT—PCR擴(kuò)增出不同片段長(zhǎng)度的病毒RNA及β-actin RNA序列,以獲得產(chǎn)物長(zhǎng)度或?qū)﹂L(zhǎng)片段擴(kuò)增的可重復(fù)性及假陰性的多少,來反映各種固定方式對(duì)病毒RNA和細(xì)胞總RNA降解的影響。結(jié)果:

1、病理切片結(jié)果顯示,經(jīng)10%福爾馬林和4%PFA固定的石蠟切片,組織結(jié)構(gòu)完整清晰。其他三種沉淀脫水類固定劑固定后組織有不同程度收縮,但不影響組織病理形態(tài)學(xué)檢測(cè),其中甲醇固定的收縮程度最小。

2、固定標(biāo)本直接提取RNA結(jié)果,(1)RNA完整性:與立即冰凍或新鮮組織比較,100%甲醇固定24h,RNA完整性損傷不明顯;75%乙醇、100%丙酮固定12h后RNA開始出現(xiàn)損傷帶,24h出現(xiàn)明顯的損傷;而10%福爾馬林、4%PFA固定6h就開始出現(xiàn)明顯的損傷,固定24 h幾乎很難看清RNA條帶。

(2)RNA得率析因分析結(jié)果顯示,不同固定劑、固定時(shí)間、固定溫度下固定的組織中所提RNA的得率有顯著性差異(P<0.01),沉淀類固定劑固定后組織RNA得率明顯高于醛類固定劑(P<0.01);三種沉淀類固定劑之間差別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義伊>0.01);4%PFA高于10%福爾馬林(P<0.01)。固定劑、固定時(shí)間和固定溫度之間有顯著性交互作用(P<0.01),4℃甲醇固定6h的RNA得率最高,10%福爾馬林在室溫下固定48h得率最低。

參考文獻(xiàn)

[1]Rapid differentiation between Hantaan and Seoul viruses by polymerase chain reaction and restriction enzyme analysis.Kim EC,Kim IS,Choi Y,et al.Journal of Medical Virology.1994

[2]Detection of HCV-RNA in paraffin-embedded liver biopsies from patients with autoimmune hepatitis.Savage K,Dhillon AP,Schmilovitz-Weiss H,et al.Journal of Hepatology.1995

[3]Epstein-Barr virus and human hepatocellular carcinoma.Shamim A,Huifeng L,Ramesh P,et al.Cancer Letters.2003

[4]Epstein-Barr virus and human hepatocellular carcinoma.Akhter S,Liu H,Prabhu R,et al.Cancer Letters.2003

[5]Relman.Detection and Identification of Previously Unrecognized Microbial Pathogens.David A.Emerging Infections.1998

[6]Relman.Detection and Identification of Previously Unrecognized Microbial Pathogens.David A.Emerging Infections.1998

[7]Differentiation between porcine epidemic diarrhea virus and transmissible gastroenreritis virus in formalin-fixed paraffin-embedded tissues by multiplex RT-nested PCR and comparison with in situ hybridization.Jung K,Kim J,Kim O,et al.Journal of Virology.2003

[8]賀莉萍.RNA病毒感染組織標(biāo)本保存方法探討[D].武漢大學(xué),2004.

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