概述[1-2]
甲基化就是人體內(nèi)新陳代謝產(chǎn)生的“甲基分子集團”貼到了蛋白質(zhì)、脫氧核糖核酸(DNA)和其他分子上。它是遺傳基因調(diào)控生命活動的重要化學反應,參與胚胎發(fā)育、衰老、腫瘤發(fā)生等諸多生理、病理過程,是身體正常運轉保持自然健康狀態(tài)所必需的。
Human靶向甲基化測序又叫人靶向甲基化測序,人甲基化測序系統(tǒng) (Human Methyl-Seq) 是全面的靶向序列捕獲系統(tǒng),可幫助研究人員關注那些已知甲基化可影響基因調(diào)節(jié)的區(qū)域:CpG islands、CpG island shores、CpG island shelves、undermethylated 區(qū)域、啟動子及差異性甲基化區(qū)域 (DMR)。
服務特點[2]
人甲基化測序系統(tǒng)通過檢測單獨的 CpG 可獨具特色地提供比甲基化芯片更多的信息,相比全基因組重亞硫酸鹽測序,可提高通量并降低成本,可發(fā)現(xiàn)限制性內(nèi)切酶及免疫沉淀或 SNP 相關方法所不能檢測的甲基化區(qū)域優(yōu)勢, 84 Mb 設計覆蓋 370 萬 CpG,不依賴于甲基化狀態(tài)的探針,高靈敏度,分辨率可達到單個堿基,提高通量并降低成本。與現(xiàn)有甲基化方法相比,可降低偏差 (bias) , 人甲基化測序系統(tǒng)測序類型包括CpG 島, GENCODE 啟動子, 癌癥、組織特異性 DMR,或以下類型的調(diào)控序列:-CpG Islands, shores/shelves (±-4 kb) -增強子-Ensemble 調(diào)控區(qū)域-DNase I 高敏感位點。用于 DNA 甲基化分析的GeneSpring NGS 軟件,快速實現(xiàn)甲基化水平、CpG 區(qū)域覆蓋、讀長對齊和堿基質(zhì)量的可視化,通過單堿基對分辨率鑒定甲基化狀態(tài)并利用特定目標基因重疊,獲得深入的生物學見解,發(fā)現(xiàn) DMR 和 DMC 的基因和基因間效應,并將其同 QPCR、ChIP測序和 RNA 測序結果相關聯(lián)。
工作流程[2]
參考文獻
[1] 新編老年學詞典
[2] Human靶向甲基化測序技術說明書