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gRNA文庫構(gòu)建方法

2020/2/19 8:06:22

概述[1]

gRNA文庫的建立將為重要基因功能的篩選、疾病機制研究及藥物研發(fā)等方面提供新的動力,大大加快人類功能基因組研究計劃的進展。

構(gòu)建方法[1]

CRISPR-Cas9系統(tǒng)是一種強大的基因組編輯工具,如風(fēng)暴一般席卷了整個基因組工程領(lǐng)域。最近Andrea Ventura等人報道了這一系統(tǒng)在gRNA 文庫構(gòu)建方面的應(yīng)用,而這樣的應(yīng)用往往需要同時表達一對gRNA,比如用Cas9切口酶進行大片段刪除。CRISPR-Cas9是細菌在漫長的進化過程中演化出的重要防御機制。這個監(jiān)控體系能夠根據(jù)引導(dǎo)RNA(gRNA)的指示,靶標并降解入侵者的遺傳物質(zhì)。

現(xiàn)在,CRISPR-Cas9已經(jīng)成為了炙手可熱的基因組編輯工具,幫助世界各地的研究者們解決實際問題。近年來,這一技術(shù)在多個領(lǐng)域中展現(xiàn)了自己強大的實力,催生了大量的重要成果。人們發(fā)現(xiàn),同時表達內(nèi)切酶Cas9與gRNA,可以誘導(dǎo)真核細胞發(fā)生雙鏈DNA斷裂。在真核生物中,雙鏈DNA斷裂主要通過容易出錯的非同源末端連接進行修復(fù),會在目標位點形成小indel(插入缺失)。因此,CRISPR-Cas9系統(tǒng)是破壞基因編碼框的一種簡單途徑。研究表明,CRIPSR-Cas9可以高效靶標多個基因,實現(xiàn)大規(guī)模的功能缺失篩選。

研究人員開發(fā)了一個快速制備配對gRNA文庫的有效方法,大大拓展了CRIPSR在功能篩選方面的應(yīng)用。該方法可以將寡核苷酸池中的一對gRNA克隆到任意CRISPR 表達載體上,還可以確保兩個gRNA使用獨立的啟動子。研究顯示,一個慢病毒載體上的兩個gRNA不適合使用相同的啟動子。研究人員為此構(gòu)建了新型慢病毒載體,搭載一個人類U6啟動子和一個經(jīng)過改良的鼠類U6啟動子。這項研究為人們提供了一個簡單、快速又便宜的配對gRNA文庫制備法,大大拓展了CRISPR技術(shù)在功能基因組學(xué)研究中的應(yīng)用前景。

主要參考資料

[1] Rapid and efficient one-step generation of paired gRNA CRISPR-Cas9 libraries

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