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全基因組甲基化測序(WGBS)的優(yōu)勢

2020/2/7 11:23:37

全基因組甲基化測序(WGBS)概述[1][2]

DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)(Epigenetics)的重要組成部分,在維持正常細(xì)胞功能、遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類腫瘤發(fā)生中起著重要的作用。全基因組甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS),其采用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA使未甲基化修飾的胞嘧啶C轉(zhuǎn)化為尿嘧啶U,通過對處理后的DNA進(jìn)行全基因組重測序,并與參考基因組進(jìn)行比對,從基因組水平實(shí)現(xiàn)單堿基分辨率的、高精確度甲基化水平分析,廣泛應(yīng)用于細(xì)胞分化、組織發(fā)育等基礎(chǔ)機(jī)制研究,以及動(dòng)植物育種、人類健康與疾病治療等研究領(lǐng)域。

全基因組甲基化測序(WGBS)優(yōu)勢[1][2]

全基因組甲基化測序(WGBS)在1992年由Frommer等提出被公認(rèn)為一項(xiàng)革命性的創(chuàng)新,已成為繪制單堿基DNA甲基化圖譜的首選方法。該方法因其通量高、耗時(shí)少、單堿基分辨率、高覆蓋率的優(yōu)勢被稱為甲基化測序的“黃金標(biāo)準(zhǔn)”。

測精度高:單堿基分辨率,精確分析每一個(gè)C堿基的甲基化狀態(tài);

檢測范圍廣:借助高通量測序平臺,對全基因組范圍內(nèi)甲基化區(qū)域進(jìn)行研究;

可靠性高:直接對甲基化片段進(jìn)行測序和定量,無交叉反應(yīng)和背景噪音;

性價(jià)比高:相比傳統(tǒng)PCR+Sanger測序方法,使用抗體富集高甲基化區(qū)域測序,費(fèi)用少。

主要參考文獻(xiàn)

1.DNA甲基化測序技術(shù)及其在哺乳動(dòng)物中的應(yīng)用研究進(jìn)展?!渡飳W(xué)雜志》2018年第5期79-82,86共5頁。

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