蛋白樣品鑒定過程一般只會(huì)使用Trypsin對蛋白進(jìn)行酶切,鑒定到的肽段覆蓋率大概在60%。為了得到靶蛋白的全部序列信息,百泰派克公司會(huì)選用在蛋白鑒定過程中常用的6種蛋白酶(Trypsin、Chymotrypsin、Asp-N、Glu-C、Lys-C和Lys-N)分別對靶蛋白進(jìn)行酶切和鑒定,在得到更多的碎裂肽段片段的同時(shí),經(jīng)過肽段之間的拼接完成蛋白序列100%的測定。百泰派克公司應(yīng)用現(xiàn)有的質(zhì)譜技術(shù)平臺(tái),提供出以LC-MS/MS為基礎(chǔ)的的肽譜圖分析,此分析可以用于確認(rèn)重組蛋白是否得到完整表達(dá),檢測重組蛋白表達(dá)過程是否發(fā)生斷裂。主要用于蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的確認(rèn),通過使用多種蛋白質(zhì)酶切反應(yīng)和液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對肽段的測序,結(jié)合專有的分析軟件,能對任何非特異性蛋白酶酶解產(chǎn)物的質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。從而實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列100%的覆蓋。
質(zhì)譜法肽段覆蓋率/肽譜圖全序列測定的流程:
• 首先使用6種蛋白酶(Trypsin、Chymotrypsin、Asp-N、Glu-C、Lys-C和Lys-N)分別對靶蛋白進(jìn)行酶切和鑒定
• 接著使用nano LC-MS/MS或者UV LC-MS/MS 對樣品進(jìn)行分析
• 將得到的肽段覆蓋率/肽譜圖全序列與您提供的理論序列進(jìn)行比對
• 得到比對結(jié)果
質(zhì)譜法肽段覆蓋率/肽譜圖全序列測定的優(yōu)點(diǎn):
(1)特異性及非特異性蛋白質(zhì)酶的組合,可實(shí)現(xiàn)對任何蛋白質(zhì)(多肽)的鑒定達(dá)到100%的覆蓋率。
(2)每個(gè)肽段的確認(rèn)包括:1)基于樣品的質(zhì)量2)基于樣品的MS/MS指紋圖譜,所以比僅使用一級質(zhì)譜進(jìn)行測定更準(zhǔn)確。
樣品要求:
膠內(nèi)樣品和溶液樣品均可以用來進(jìn)行上述測序
樣品純度越高越好,建議超過80%的蛋白質(zhì)
需要的靶蛋白樣品量:10-20ug
蛋白質(zhì)膠樣品也可用于肽段覆蓋率測定,但需對樣品進(jìn)行特殊的前處理。
案例分析:
蛋白樣品100%序列驗(yàn)證服務(wù)
在實(shí)際的實(shí)驗(yàn)過程中,按照盡量提高效率和降低花費(fèi)的原則,我們會(huì)首先對客戶提供的理論序列進(jìn)行分析,分析過程是按照幾種不同的蛋白酶酶切位點(diǎn)進(jìn)行肽段覆蓋率的預(yù)測,假如可以僅僅通過3種蛋白酶酶切就可以100%的覆蓋全序列,實(shí)際實(shí)驗(yàn)過程就會(huì)先用這3種蛋白酶進(jìn)行酶切和后續(xù)的序列分析實(shí)驗(yàn),這樣可以有效的降低實(shí)驗(yàn)的成本。以下是之前項(xiàng)目的部分?jǐn)?shù)據(jù),該項(xiàng)目中客戶按照理論序列表達(dá)抗體藥物,一級序列需要進(jìn)行驗(yàn)證,以證明表達(dá)得到的抗體與理論序列一致,部分實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)展示如下:
結(jié)題報(bào)告中,我們會(huì)按照下圖所示的方式給出肽段覆蓋率的詳細(xì)數(shù)據(jù)。
中/英文項(xiàng)目報(bào)告
在技術(shù)報(bào)告中,百泰派克會(huì)為您提供詳細(xì)的中英文雙語版技術(shù)報(bào)告,報(bào)告包括:
1. 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文)
2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文)
3. 質(zhì)譜圖片
4. 原始數(shù)據(jù)
5. 生物藥物肽段覆蓋率信息
生物藥物肽段覆蓋率分析一站式服務(wù)
您只需下單-寄送樣品
百泰派克一站式服務(wù)完成:樣品處理-上機(jī)分析-數(shù)據(jù)分析-項(xiàng)目報(bào)告
關(guān)鍵字: 肽段覆蓋率/肽譜圖分析;
北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd. 簡稱BTP)成立于2015年,是國家級高新技術(shù)企業(yè),業(yè)務(wù)范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測兩大板塊,從事蛋白質(zhì)和小分子代謝物的理化性質(zhì)分析及結(jié)構(gòu)解析等相關(guān)技術(shù)服務(wù),為客戶提供高性價(jià)比、高效率的技術(shù)服務(wù)。深耕蛋白鑒定、定量蛋白組(iTRAQ/TMT、label free、DIA/SWATH)、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗體測序、蛋白修飾(二硫鍵、糖基化、磷酸化、乙?;?、泛素化等)、靶向和非靶向代謝物檢測。
百泰派克生物科技檢測平臺(tái)包括:檢測分析平臺(tái)、蛋白質(zhì)組學(xué)分析平臺(tái)、代謝組學(xué)分析平臺(tái)、蛋白質(zhì)從頭測序平臺(tái)、生物制藥分析平臺(tái)和流式細(xì)胞多因子檢測平臺(tái)。公司擁有獨(dú)立的質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)室、色譜實(shí)驗(yàn)室、細(xì)胞培養(yǎng)室和免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)室,以及高分辨率質(zhì)譜儀和高效液相色譜。目前已與國內(nèi)外多家藥物研發(fā)企業(yè),以及哈佛大學(xué)、北京大學(xué)在內(nèi)的國內(nèi)外高校建立了合作關(guān)系,協(xié)助客戶發(fā)表了多篇中英文文章,包括Cell等多家高水平期刊。
公司自主檢測平臺(tái)發(fā)展至今,已覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、生物制藥、生信分析等多組學(xué)檢測平臺(tái),積累了豐富的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),憑借專業(yè)的技術(shù)和優(yōu)質(zhì)的服務(wù)水平,客戶覆蓋北京大學(xué)、清華大學(xué)、中科院等多所知名院校,也與國內(nèi)外多家藥物研發(fā)企業(yè)建立合作關(guān)系。公司始終致力于為各科研院校、企業(yè)和機(jī)構(gòu)提供高效、準(zhǔn)確、高性價(jià)比的蛋白質(zhì)(組)研究技術(shù)包裹,助力客戶在基礎(chǔ)研究、分子診斷及其他生命科學(xué)研究領(lǐng)域取得突破,為生命科學(xué)的發(fā)展做出貢獻(xiàn)。
百泰派克技術(shù)平臺(tái)
檢測分析平臺(tái):多臺(tái)高分辨率質(zhì)譜儀、高效液相色譜、氣相色譜,NMR。
蛋白質(zhì)組分析平臺(tái):Label-free、iTRAQ、SILAC、SWATH、MRM;蛋白質(zhì)定性定量鑒定、蛋白質(zhì)差異分析、發(fā)現(xiàn)疾病標(biāo)記物、發(fā)現(xiàn)藥物靶標(biāo)。
代謝組分析平臺(tái):靶向代謝組學(xué)、非靶向代謝組學(xué)、脂質(zhì)組學(xué)分析;通量達(dá)1000種代謝分子、代謝通路分析、代謝靶標(biāo)鑒定。流式細(xì)胞多因子檢測平臺(tái):CBA、FlowCytomix;微量樣品需求,分析多種細(xì)胞因子。
蛋白質(zhì)從頭測序平臺(tái):Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀、PEAKS軟件分析;100%序列測定,精準(zhǔn)蛋白、抗體測序。
生物制藥分析平臺(tái):生物藥物鑒定、變異性分析、純度分析。
流式細(xì)胞多因子檢測平臺(tái):CBA、FlowCytomix;微量樣品需求,分析多種細(xì)胞因子。
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