VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina
VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina
高效修復(fù)DNA損傷: 有效修復(fù)堿基損傷、切刻、缺口和3’端封閉等問題
建庫效率高: 文庫轉(zhuǎn)化率和擴(kuò)增產(chǎn)出雙提升
模板兼容性廣: 兼容 gDNA,F(xiàn)FPE DNA,cfDNA,Amplicons 等樣本
完美兼容不同質(zhì)量樣本: DNA修復(fù)酶對(duì)不同DIN值的FFPE DNA均有極佳的表現(xiàn)
建庫耗時(shí)短: 單個(gè)文庫構(gòu)建最短僅需90min
1.FFPE損傷類型以及澤葉生物 FFPE DNA修復(fù)混合液的修復(fù)能力
2.高效修復(fù)堿基損傷
以FFPE樣本為模板,參照各公司建庫流程進(jìn)行文庫構(gòu)建,使用HiSeq X10 PE150進(jìn)行測序。結(jié)果顯示,VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(澤葉生物 #ZY608)的高效修復(fù)功能使得堿基異常突變數(shù)量顯著低于同類產(chǎn)品及澤葉生物常規(guī)DNA建庫產(chǎn)品(澤葉生物 #ZY607),性能卓越。
圖1.ND608與其他公司同類型產(chǎn)品及ND607,堿基異常突變數(shù)量統(tǒng)計(jì)對(duì)比
3.建庫效率高,完美兼容FFPE、gDNA等樣本
(1) 高效的文庫轉(zhuǎn)化率
以等量的片段化DNA和FFPE DNA為模板,參照各公司建庫流程構(gòu)建PCR-Free文庫,再進(jìn)行qPCR文庫定量。VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(澤葉生物 #ZY608)相比同類產(chǎn)品和澤葉生物常規(guī)DNA建庫產(chǎn)品(澤葉生物 #ZY607)在文庫轉(zhuǎn)化率上表現(xiàn)更優(yōu)越,確保了文庫的豐富度。
圖2.ND608 與其他公司同類型產(chǎn)品及 ND607,有效文庫產(chǎn)出對(duì)比
(2)優(yōu)越的文庫擴(kuò)增效率
以等量的片段化DNA和FFPE DNA為模板,參照各公司建庫流程進(jìn)行文庫構(gòu)建,用Qubit檢測文庫濃度。結(jié)果表明 VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(澤葉生物 #ZY608)在相同的循環(huán)數(shù)下比同類產(chǎn)品及澤葉生物常規(guī)DNA建庫產(chǎn)品(澤葉生物 #ZY607)文庫產(chǎn)量有了極大的提高;在相同產(chǎn)量下比其他公司同類產(chǎn)品所需循環(huán)數(shù)可減少2~3個(gè)cycles,從而降低了高循環(huán)數(shù)引入的擴(kuò)增偏好性。
圖3.ND608與其他公司同類型產(chǎn)品及ND607,文庫產(chǎn)出對(duì)比
4.顯著提升測序數(shù)據(jù)質(zhì)量
以300 ng小鼠FFPE DNA為模板,參照各公司建庫流程進(jìn)行文庫構(gòu)建,使用HiSeq X10 PE150進(jìn)行測序,測序深度3×。結(jié)果顯示,VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(澤葉生物 #ZY608)在測序數(shù)據(jù)質(zhì)量上較同類產(chǎn)品及澤葉生物常規(guī)DNA建庫產(chǎn)品(澤葉生物 #ZY607)表現(xiàn)更優(yōu)越。
圖4.ND608與其他公司同類產(chǎn)品及ND607,測序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina®是包含F(xiàn)FPE DNA修復(fù)模塊的Illumina®高通量測序平臺(tái)文庫構(gòu)建試劑盒。本試劑盒可以將100 pg - 1 μg Input DNA轉(zhuǎn)換成Illumina®平臺(tái)專用文庫。本試劑盒包含DNA損傷修復(fù)模塊,能夠有效修復(fù)福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)導(dǎo)致的DNA損傷,如胞嘧啶脫氨、切刻和缺口、堿基氧化、3’端封閉等,同時(shí)兼容普通DNA樣本,不會(huì)影響正常DNA樣本文庫質(zhì)量。通過對(duì)末端修復(fù)模塊、連接模塊和文庫擴(kuò)增模塊的整體改進(jìn),使文庫轉(zhuǎn)化率和擴(kuò)增文庫產(chǎn)出大幅提升,廣泛適用于多種樣本的PCR或PCR-Free文庫構(gòu)建,且兼容靶向捕獲流程。試劑盒中提供的所有試劑都經(jīng)過了嚴(yán)格的質(zhì)量控制和功能驗(yàn)證,程度上保證了文庫構(gòu)建的穩(wěn)定性和重復(fù)性。
組分
ZY608-01 (24 rxn)
ZY608-02 (96 rxn)
DNA Damage Repair Enzyme
48 μl
192 μl
End Prep Buffer
240 μl
960 μl
End Prep Enzyme
120 μl
480 μl
Rapid Ligation Buffer 2
600 μl
4 × 600 μl
Rapid DNA Ligase
120 μl
480 μl
VAHTS HiFi Amplification Mix
600 μl
4 × 600 μl
PCR Primer Mix 3 for Illumina
120 μl
480 μl
Control DNA (264 bp,50 ng/μl)
10 μl
10 μl
-30 ~ -15℃保存。-20 ~ 0℃運(yùn)輸。
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上海澤葉生物科技有限公司是一家服務(wù)于生命科學(xué)領(lǐng)域的高新技術(shù)企業(yè),主要為科研機(jī)構(gòu)、高校、院所及企業(yè)產(chǎn)品開發(fā)研究提供所需要的科研類試劑、耗材、儀器、技術(shù)服務(wù)等。包括分子生物學(xué)、免疫學(xué)、微生物學(xué)、細(xì)胞學(xué)、材料科學(xué),通用試劑、藥物合成試劑、手性化合物、催化劑及配體、分析試劑、生物試劑,檢測試劑等等