DNA去磷酸化試劑盒
產(chǎn)品及特點 分子克隆時,載體的自連極大降低了連接效率,如果對載體 DNA 兩個 5′端的-PO4 基團進行去磷酸化處理,則可以抑制自連反應(yīng)。此外在進行 DNA 5′端標(biāo)記前,也需要將其本來的-PO4 基團去除以便加上標(biāo)記基團。本公司開發(fā)的 DNA 去磷酸化產(chǎn)品就是針對這一目的而開發(fā)。它具有下列特點:
1. 把 DNA 5′端的-PO4 基團變成-OH 基團,使其喪失連接能力。
2. 模板可以是單鏈 DNA,也可以是雙鏈 DNA,既可以是平末端,也可以是 5′端突出或 3′端突出的粘性末端。
3. 處理后的核酸純化后可以直接用于連接反應(yīng)和標(biāo)記反應(yīng)。
4. 本產(chǎn)品足夠 20 次 20μL 體系的去磷酸化實驗
5. 本產(chǎn)品僅供科研使用。
規(guī)格及成分成 份 編 號 塑料袋包裝
10×去磷酸緩沖液 130828a 50 μL(紫蓋)
堿性磷酸酶 130828b 10 μL(紅蓋)
超純水 100935 1 mL(藍蓋)
使用手冊 130828sc 1 份
運輸及保存 低溫運輸,-20℃保存,有效期為 12 個月。
自備試劑 DNA 片段
使用方法 注意:dNTP 和 ATP 也是堿性磷酸酶的底物,所以如果 DNA 溶液中有 dNTP(比如 PCR 產(chǎn)物中)和 ATP,一定要先將其去除,否則它們會耗掉大量的堿性磷酸酶活性,降低 DNA 去磷酸化效率。
一、純化 DNA 片段的去磷酸化
1、在微量離心管中配制下列反應(yīng)液(20μL):
成 分 用 量
膠回收的 DNA 片段 1 pmol(相當(dāng)于 1ug 3Kb 的線狀質(zhì)粒)
10×去磷酸緩沖液 2 μL
堿性磷酸酶 0.5 μL
超純水到 20 μL
2、建議在 37℃反應(yīng) 30 分鐘(對平末端、5′端突出或 3′端突出的 DNA 片段均采用此保溫條件)。
3、65℃反應(yīng) 5 分鐘變性堿性磷酸酶。
4、DNA 片段可以直接用于連接。
二、限制性酶切反應(yīng)的同步去磷酸化
5、本堿性磷酸酶在幾乎所有限制性內(nèi)切酶的緩沖液中都有活性,所以可以按 1ug3Kb DNA 加 1μL 堿性磷酸酶的比例直接加到限制內(nèi)切酶的反應(yīng)液中(反應(yīng)液中不能含 dNTP 和 ATP)。
6、加熱滅活限制性內(nèi)切酶和堿性磷酸酶(滅活條件根據(jù)限制性內(nèi)切酶不同而不同,但不能低于 65℃,時間不能短于 5 分鐘,否則不能滅活堿性磷酸酶)。滅活后的樣品可以直接用于后續(xù)實驗。
7、如果不能采取加熱滅活限制性內(nèi)切酶和堿性磷酸酶,則需酚/氯仿抽提去除酶。具體操作如下(本試劑盒不提供相關(guān)試劑,需要從本公司另購相關(guān)試劑,下列操作僅供參考):
附:酚/氯仿抽提去除酶步驟:
1、在反應(yīng)液中加入超純水使體積變成 100μL,以免純化過程中 DNA 丟失。如果有必須,可以加入和 4μL 核酸助沉劑提高回收效率。
2、加入 100μL 酚/氯仿/異戊醇 25:24:1 混合液震蕩半分鐘混勻,室溫 12000g離心 3 分鐘,轉(zhuǎn)移上清到新離心管中。
3、加 0.1 倍體積(即 10μL)的 3 M 乙酸鈉溶液(pH 5.2)。
4、再加入 2.5 倍體積(即 250μL)的無水乙醇。
5、混勻后 12000g 4℃離心 10 分鐘,小心棄上清。
6、加入 1mL 70%乙醇,短暫離心 3 分鐘后小心棄上清。
7、短暫離心 5 秒,吸棄殘留液體(約 30-50μL)。
8、室溫放置 2 分鐘干燥后加入適量的超純水溶解 DNA,立即使用或放-20℃長期保存。
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