簡單介紹:iTRAQ和TMT的技術(shù)原理一樣,所不同的是二者的分子結(jié)構(gòu)有差異。與SILAC相比(標記蛋白質(zhì)),iTRAQ和TMT是對肽段進行標記的。依據(jù)iTRAQ/TMT標簽的質(zhì)量數(shù)差異,通過MS實現(xiàn)對多組樣品中的蛋白質(zhì)進行相對定量:SILAC是通過上等MS( MSl)對蛋白質(zhì)進行定量,而iTRAQ/TMT是通過二級MS( MS/MS.MS2)進行定量的jiTRAQ/TMT能兼容所有來源的蛋白質(zhì)樣品,并且能同時分析多達8-10組的樣品,分析通量高。
實驗步驟:
1、分別提取蛋白質(zhì)并定量;2、Trypsin分別對蛋白進行酶解,提取肽段;3、用不同質(zhì)量數(shù)的iTRAQ/TMT標簽分別對肽段樣品進行標記:4、標記完成后,混合樣品,用SCX進行組分分離(15-20組分);5、對每個組分進行LC-MS分析:6、蛋白質(zhì)鑒定與定量分析,篩選差異表達的蛋白;7、生物學實驗驗證(Western blot,EUSA等):
技術(shù)優(yōu)勢1、高通量,能同時進行多達8-10組樣品蛋白質(zhì)組的定性與定量分析;?2、兼容所有來源的樣品(動植物組織、**、血液等);?3、實驗周期短。 ?
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