染色質免疫共沉淀（ChIP）是在體內環(huán)境中研究蛋白質與DNA相互作用的經典實驗方法，廣泛應用于組蛋白修飾、特定轉錄因子的基因調控作用等相關領域。隨著新一代測序技術的發(fā)展和成熟，染色質免疫沉淀實驗與高通量測序的整合——Chromatin Immunoprecipitation Sequencing （ChIP Sequencing ），可在全基因組范圍對蛋白結合位點進行高效而準確的篩選與鑒定，同時也為研究的深入開展打下基礎。
?? ? ? 采用特異性抗體對目的蛋白進行免疫沉淀后，分離與其結合的基因組DNA片段，再通過高通量測序與數(shù)據(jù)分析，在全基因組范圍內尋找目的蛋白的DNA結合位點，并且可以基于多個樣品進行差異比較。

技術優(yōu)勢:

• 檢測范圍廣：全基因組范圍的免疫沉淀與測序分析；
• 高性價比：基于抗體富集目標區(qū)域，有效降低測序數(shù)據(jù)量；
• 微量樣本：只需10 ng以上免疫沉淀后的DNA，即可進行測序分析。

研究內容:
一、標準信息分析?
1)???????? 去接頭污染，去低質量reads和產量情況統(tǒng)計；
2)???????? ChIP 測序序列與參考基因組序列的比對；
3)???????? ChIP 測序Reads 在全基因組的分布；
4)???????? 統(tǒng)計ChIP測序數(shù)據(jù)富集區(qū)域( Peak ) 的信息；
5)???????? Peak相關基因篩選與GO功能聚類分析；
6)???????? 多個樣品的差異分析；
7)???????? UCSC Genome Browser使用說明；
二、高級信息分析
?不同表達水平的基因在TSS附近區(qū)域的reads 富集程度。
三、定制化信息分析
可結合客戶的需求，協(xié)商確定定制化信息分析內容。?
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