染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)結(jié)合定量PCR可用于研究已知基因組結(jié)合位點(diǎn)處的蛋白質(zhì)- DNA相互作用。如果位點(diǎn)未知,qPCR引物也可以針對潛在的調(diào)控區(qū)域(例如啟動子)進(jìn)行設(shè)計(jì)。ChIP - qPCR在關(guān)注特定基因和潛在調(diào)控區(qū)域的研究中具有優(yōu)勢,因?yàn)閝PCR的成本極低,可以在不同的實(shí)驗(yàn)條件下進(jìn)行。該技術(shù)現(xiàn)在用于各種生命科學(xué)學(xué)科,包括細(xì)胞分化,腫瘤抑制基因沉默以及組蛋白修飾對基因表達(dá)的影響等。
實(shí)驗(yàn)原理
甲醛使DNA與其結(jié)合蛋白交聯(lián),通過超聲波或酶處理,使染色質(zhì)斷裂為小片段,加入特定抗體,對目的基因進(jìn)行標(biāo)記,免疫沉淀得到靶片段,解交聯(lián)得到基因片段,獲得的基因片段可用于后續(xù)PCR分析。
檢測流程
染色質(zhì)準(zhǔn)備→染色質(zhì)剪切→染色質(zhì)免疫沉淀→DNA純化→qPCR
檢測方法
技術(shù)方法:熒光定量PCR
樣本類型:細(xì)胞、組織
實(shí)驗(yàn)周期:2~3星期
上海啟因生物科技有限公司
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