貫葉連翹提取物在歐洲(尤其是德國)長期被用作抗抑郁藥物，但關(guān)于其機制及有效成分的研究仍在探索中。
    一般認為，貫葉連翹與普通抗抑郁藥物一樣，抑制去甲腎上腺素和5-羥色胺的再吸收。有理論認為，貫葉連翹在多方面同時起作用：抑制去甲腎上腺素、5-羥色胺和多巴胺再吸收；低水平的MAOI(單胺氧化酶抑制劑)；作用于下丘腦，抑制皮質(zhì)醇分泌。也有理論認為貫葉連翹粗提物對一些腦神經(jīng)傳質(zhì)有關(guān)的化合物受體有良好的親和力，如GABA(γ-氨基丁酸)。GABA是鎮(zhèn)定中樞神經(jīng)的主要物質(zhì)之一，新的研究表明，GABA與抗抑郁也有關(guān)系。抑郁癥患者的GABA水平很低，而能夠增強GABA活性的藥物也有抗抑郁效果。又有人提出貫葉連翹抑制白介素-6活性，后者是一種促進免疫的化學物質(zhì)，能引起抑郁癥。而貫葉連翹可用于治療更年期抑郁癥是由于所含的一種溫和的植物激素——β-谷甾醇的作用。
    普遍的觀點是：貫葉連翹抗抑郁的有效成分是金絲桃素，它通過MAOI機制起作用。但研究者們對金絲桃素就是有效成分及對MAOI機制本身表示懷疑，提出了新的可能有效成分：黃酮類(與MAOI有相似的化學結(jié)構(gòu))，如阿曼托黃素；山酮類(抑制MAO-A，MAO-B)及其它未知成分，并認為可能是幾種物質(zhì)協(xié)同作用。
    許多研究可為貫葉連翹抗抑郁的有效性和安全性提供證據(jù)，最具說服力的是Linde等用metoanalysis統(tǒng)計學方法處理隨機臨床實驗的報道。該文獻表明：在治療輕度和中度抑郁癥時，貫葉連翹明顯優(yōu)于安慰劑，與標準抗抑郁藥物(三環(huán)類)相比，療效相同而副作用較小。
    但Linde的實驗療程短，劑量小，只考察了輕度和中度抑郁癥患者，未和其它標準抗抑郁藥(MAOIs, SSRIs, Effexnor, Paxil等)作對比研究，因而認為貫葉連翹可以完全替代抗抑郁藥的結(jié)論還不成熟。同時，貫葉連翹仍有一些副作用，包括與MAOIs的相互作用、5-羥色胺綜合征、光敏作用、刺激腸胃、疲乏、失眠和變態(tài)反應等。
    貫葉連翹的LD50未見報道，但某些活性成分的LD50是已知的。如金絲桃苷(hyperin)的LD50＝(0.5±0.014) g/kg。而以35倍于標準劑量的貫葉連翹提取物作用于志愿者，只有很小的副作用。表明貫葉連翹具有較高的LD50和較低的毒性。