品名:Smart-REMSA? RNA EMSA Kit,貨號(hào):IF9502,品牌:Engibody訂購(gòu)及技術(shù)咨詢:朱小鷗,13817407320(微信同號(hào))
NIH、麻省理工、哈佛、斯坦福等世界名校課題組青睞并長(zhǎng)期采購(gòu)的RNA EMSA試劑盒!Smart-REMSA? RNA EMSARNA電泳凝膠遷移阻滯實(shí)驗(yàn)試劑盒RNA EMSA技術(shù)的現(xiàn)狀分析RNA EMSA實(shí)驗(yàn)所需試劑較多,加上生物素探針的合成和標(biāo)記、蛋白樣本的制備、RNA EMSA凝膠的配制、帶正電荷的尼龍膜(特別昂貴)、RNA EMSA專用電泳液和RNA EMSA專用轉(zhuǎn)膜液等,費(fèi)用不小。還需要一些設(shè)備如電泳儀與轉(zhuǎn)膜儀、化學(xué)發(fā)光成像儀等。 從市場(chǎng)逐個(gè)購(gòu)買試劑,費(fèi)時(shí)費(fèi)力,費(fèi)用不菲,且試劑與試劑之間難以協(xié)調(diào)匹配,遇到各種技術(shù)問(wèn)題也無(wú)法解決。 有了復(fù)名表觀遺傳學(xué)的RNA EMSA試劑盒,這些問(wèn)題全部迎刃而解,最小的費(fèi)用和時(shí)間搞定RNA EMSA實(shí)驗(yàn)。而且實(shí)驗(yàn)者跟隨本RNA EMSA試劑盒操作步驟可熟悉與掌握該項(xiàng)技術(shù),節(jié)約很多時(shí)間和費(fèi)用,遇到問(wèn)題可以找復(fù)名表觀遺傳學(xué)技術(shù)支持輕松解決,文末有技術(shù)支持的微信二維碼,可以隨時(shí)添加好友。Smart-REMSA? RNA EMSA試劑盒的4大優(yōu)勢(shì)1、本試劑盒適用于貼壁細(xì)胞、懸浮細(xì)胞、動(dòng)物組織、植物組織及純化后的重組蛋白,是個(gè)真正的多合一Kit。 2、本試劑盒包含適用于驗(yàn)證型RNA-EMSA、競(jìng)爭(zhēng)型RNA-EMSA及SuperShift超遷移RNA-EMSA的試劑。 3、本試劑盒采用化學(xué)發(fā)光法檢測(cè),而非采用放射性同位素檢測(cè),具有高靈敏度,且對(duì)實(shí)驗(yàn)人員健康無(wú)任何傷害。 4、本說(shuō)明書是一本RNA EMSA實(shí)驗(yàn)的全面技術(shù)手冊(cè),透徹分析了REMSA實(shí)驗(yàn)中的重點(diǎn)、難點(diǎn),對(duì)各種重點(diǎn)難點(diǎn)問(wèn)題都有針對(duì)性的解決方案。同時(shí)包含了表觀遺傳學(xué)的基礎(chǔ)知識(shí)和基本脈絡(luò),匯總了RNA與各種蛋白互作的詳細(xì)信息??赐赀@本保姆級(jí)說(shuō)明書,所有疑難都會(huì)迎刃而解,RNA EMSA盡在掌握之中。第一部分:背景簡(jiǎn)介及應(yīng)用場(chǎng)景RNA與蛋白質(zhì)相互作用分析95%的人類基因組實(shí)際上并不編碼蛋白質(zhì),而是產(chǎn)生大量非編碼RNA,這些RNA在生命的生長(zhǎng)和發(fā)育中發(fā)揮著重要的調(diào)節(jié)作用,與艾滋病病毒/艾滋病、白血病、糖尿病等各種疾病密切相關(guān),并參與干細(xì)胞發(fā)育和表觀遺傳學(xué)的調(diào)節(jié)。RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物驅(qū)動(dòng)幾乎所有細(xì)胞過(guò)程中基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié),包括剪接、核輸出、mRNA穩(wěn)定性和蛋白質(zhì)翻譯。因此,對(duì)轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和機(jī)制的理解取決于確定這些過(guò)程中RNA結(jié)合的變化。 RNA結(jié)合蛋白通過(guò)與單鏈RNA結(jié)合基序(RBM)結(jié)合來(lái)控制細(xì)胞生物學(xué)的許多方面。然而,RBM可以隱藏在其局部RNA結(jié)構(gòu)中,從而抑制RNA與蛋白質(zhì)的相互作用。 RNA與蛋白質(zhì)相互作用的研究越來(lái)越受到科學(xué)家的關(guān)注,成為表觀遺傳學(xué)研究的熱點(diǎn)。 目前RNA研究的國(guó)自然熱點(diǎn)主要是mRNA、LncRNA、miRNA、circRNA。RNA-EMSA(RNA Electrophoretic Mobility Shift Assay),凝膠遷移實(shí)驗(yàn)又稱凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)或電泳遷移率改變實(shí)驗(yàn),其原理是RNA-binding proteins (RBPs) 蛋白-RNA探針復(fù)合物在聚丙烯酰胺凝膠電泳中比自由探針遷移更慢,是一種用于體外In Vitro檢測(cè)RNA-binding proteins (RBPs) 蛋白與RNA片段相互作用的技術(shù)。 1、RNA-EMSA和RIP、CLIP、RNA Pull-down,這四種研究RNA-蛋白互作技術(shù)的內(nèi)在區(qū)別是什么?1)、RNA-EMSA———RNA電泳凝膠遷移阻滯實(shí)驗(yàn)(Electrophoretic Mobility Shift Assay),In Vitro體外通過(guò)RNA探針檢測(cè)目的蛋白,反向驗(yàn)證了RIP。是經(jīng)典方法。 2)、RIP———RNA蛋白免疫沉淀技術(shù)是一種用于在細(xì)胞天然背景下In Vivo體內(nèi)探測(cè)蛋白質(zhì)-RNA 相互作用的技術(shù)。這種方法可以用于檢測(cè)特定RBP蛋白與RNA的結(jié)合水平。 3)、RNA Pull-down———In Vitro體外通過(guò)RNA探針捕獲目的蛋白或其他候選蛋白,獲取蛋白后進(jìn)行WB檢測(cè)或MS質(zhì)譜鑒定。也是經(jīng)典方法。 4)、CLIP———這是近年來(lái)的新興技術(shù),紫外交聯(lián)RNA-RBP免疫沉淀技術(shù),可以分為HITS-CLIP(CLIP-Seq)、PAR-CLIP、iCLIP、miCLIP。 2、RNA-EMSA和RIP的聯(lián)合分析,相互驗(yàn)證這是經(jīng)典研究策略,RIP是體內(nèi)In Vivo研究RNA和蛋白互作,RNA-EMSA是體外In Vitro進(jìn)行RNA和蛋白互作的驗(yàn)證,互相印證。 第二部分:技術(shù)原理和技術(shù)流程技術(shù)原理: 當(dāng)RNA探針與蛋白樣本混合孵育時(shí),樣本中可以與RNA探針結(jié)合的蛋白與探針形成蛋白-探針復(fù)合物,這種復(fù)合物由于分子量很大,在進(jìn)行PAGE電泳時(shí)遷移較慢,而沒(méi)有結(jié)合蛋白的自由RNA探針則遷移較快,跑在凝膠的前沿。孵育的樣本在進(jìn)行PAGE電泳分離并轉(zhuǎn)膜(正電荷尼龍膜)后,蛋白-探針復(fù)合物會(huì)在膜靠前的自由探針位置后方再形成一條目的條帶,說(shuō)明有蛋白與目標(biāo)探針發(fā)生了互作。 技術(shù)流程:根據(jù)實(shí)驗(yàn)者研究的靶標(biāo)蛋白類型不同,采用3種略有不同的技術(shù)流程1、驗(yàn)證型RNA EMSA如果樣本是純化后的重組蛋白,沒(méi)有其他雜蛋白的干擾,只需要設(shè)計(jì)含有陰性對(duì)照的最簡(jiǎn)單的實(shí)驗(yàn)方案即可。 2、競(jìng)爭(zhēng)型RNA EMSA如果樣本是細(xì)胞漿或者細(xì)胞核蛋白提取物,樣本里除了目的蛋白,還有很多其他各種蛋白,容易和RNA探針發(fā)生非特異性結(jié)合,這時(shí)就需要設(shè)計(jì)野生型冷探針競(jìng)爭(zhēng)對(duì)照組和突變型冷探針競(jìng)爭(zhēng)對(duì)照組來(lái)排除非特異性結(jié)合。 3、SuperShift超遷移RNA EMSA如果還想對(duì)目的蛋白進(jìn)行進(jìn)一步確定,可以在蛋白樣本中加入探針及靶標(biāo)蛋白的抗體,形成三元復(fù)合物,這樣電泳遷移率進(jìn)一步變慢,得到超遷移條帶。第四部分:RNA EMSA實(shí)驗(yàn)結(jié)果與示例展示展示2個(gè)結(jié)果示例,如下列圖片所示:
The RNA-EMSA assay(A)RNA寡核苷酸探針。(B)(1:1)在1×TBE緩沖液中滴加1μm探針。(C&D)與重組HuR (RNA結(jié)合蛋白)相比,用非變性粗細(xì)胞裂解物運(yùn)行固定濃度的探針(62.5 nM)。(C&D)中的數(shù)據(jù)代表了至少兩個(gè)獨(dú)立的實(shí)驗(yàn)。RNA-EMSA assay of the IRE/IRP exampleRAW264.7巨噬細(xì)胞IRE結(jié)合活性的鐵依賴性調(diào)節(jié)。107個(gè)細(xì)胞制備細(xì)胞質(zhì)裂解物,IRE探針通過(guò)RNA-EMSA進(jìn)行分析。IRE/IRP1和IRE/IRP2復(fù)合物以及游離IRE探針的位置由箭頭指示。 第五部分:RNA-EMSA試劑盒組分清單(共計(jì)13個(gè)組分,均可單獨(dú)購(gòu)買)
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