產(chǎn)品介紹
激發(fā)波長 (nm): 647
發(fā)射波長 (nm): 670
菁染料已在紡織品等領(lǐng)域使用多年。它們在核酸標(biāo)記中的應(yīng)用首先是琥珀酰亞胺酯的商業(yè)供應(yīng)增加,后來作為亞磷酰胺使用增加。如今,它們基于熒光團標(biāo)記和檢測成為許多診斷平臺和檢測的核心部分。菁染料在寡核苷酸合成中用作熒光標(biāo)記,主要用于分子診斷,例如制備用于監(jiān)測實時熒光定量PCR、熒光原位雜交(FISH)和基于表面增強共振拉曼光譜(SERRS)的DNA檢測測定的探針。它們的發(fā)射光譜可以通過改變聚甲炔鏈的長度來調(diào)整,并且在有機或水溶劑中的溶解度可以通過芳環(huán)上的取代基改變。最常用的經(jīng)典亞磷酰胺染料是Cyanine-3和Cyanine- 5(結(jié)構(gòu)上相當(dāng)于Cy3和Cy5)。在合成過程中,它們通常連接在寡核苷酸的5'端上,但很容易摻入序列中。MMT保護的羥基以與DMTr保護相同的方式被去除。由于它們的結(jié)構(gòu)中缺乏雜環(huán)堿基,而且它們沒有參與堿基配對的能力,因此摻入序列內(nèi)部并不常見。這使得雙鏈的形成變得不穩(wěn)定性。對于3'-連接,可以引入等效的3'-修改的CPG載體。以前,這是通過合成后將染料添加到氨基修飾的寡核苷酸上或通過將亞磷酰胺添加到具有官能化的修飾的載體中來完成的,該修飾不會干擾寡核苷酸(例如磷酸酯、連接間隔)的使用。3'-標(biāo)記在FRET中特別有用,其中FRET匹配對標(biāo)記在5'末端或摻入寡核苷酸序列中。Quasar系列染料可以替代Cy 3,Cy 5和Cy 5.5;Quasar570、Quasar670和Quasar705的發(fā)射波長分別為570、670和705 nm。Quasar染料增加了熒光團的選擇,并有助于消除與多重qPCR相關(guān)的潛在交叉問題。它們通過BHQ-2或BHQ-3高效淬滅,可用于許多不同的探針形式。Quasar CPG和亞磷酰胺可用于寡核苷酸的直接標(biāo)記。活性酯可用于偶聯(lián)到底物(如蛋白質(zhì)、肽和寡核苷酸)上的胺基。羧酸變體用于標(biāo)記肽、寡核苷酸或功能化胺。
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